单细胞RNA-seq数据分析最佳实践（下） / 开普饭

编译:寒江雪,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在过去的十年里,单细胞RNA测序与计算算法相结合,为研究组织和器官的细胞类型组成以及推测细胞发育轨迹开辟了新的途径.这些技术已经应用 ...

Single-cell transcriptomics of the mouse kidney reveals potential cellular targets of kidney disease ...

编译:Nicole,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 脊椎动物后脑的分割导致菱脑节的形成,每个菱脑节具有独特的身份.专门的边界细胞充当神经元分化的来源或调节者.在斑马鱼中,存在神经发生的 ...

编译:刘娟,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞水平的分子异质性研究技术加深了我们对包括动脉粥样硬化斑块在内的组织中细胞生物多样性的了解.现有的商业化系统能从成千上万个单细胞中 ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读背景:肾小球是由三种不同的细胞组成,它们分别是系膜细胞.内皮细胞和足细胞.然而,健康肾小球细胞群体中存在的细胞异质性仍是未知的.方法: ...

编译:艾奥里亚,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞转录学能够在单个细胞的分辨率层面下测量复杂生物系统中的基因表达.单细胞数据的多元分析有助于描述胚胎发育.疾病进展以及对应激响 ...

文献来源 Kharchenko, Peter V. The triumphs, and limitations of computational methods for scRNA-seq. Natu ...

编译:Tigobin,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 确定实体肿瘤的复杂成分是了解肿瘤发生.发展和转移的基础.虽然患者来源的样本提供了有价值的观点,但它们在多个分子水平上存在异质性,而 ...

编译:贤,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肾脏是具有许多不同功能且高度复杂的器官,肾小球和肾小管是肾单位的重要组成部分:这些结构的功能复杂性可能与其不同的细胞类型有关.目前已有研 ...

编译:杨峰,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 哺乳动物半月板是由内侧和外侧两部分组成的新月形组织,在关节稳定性.减震.接触力分布.关节润滑和本体感觉等方面发挥着重要作用.随着年龄的增长, ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读人体睾丸在青春期会经历剧烈的发育和结构变化,包括体细胞生态细胞的增殖和成熟以及精子发生.为了研究这个过程,研究者测序分析了四个青春期男 ...

编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞RNA测序(scRNA-seq)是研究脑和中枢神经系统(CNS)中单个细胞转录组的一种有前途的方法.这项技术充当了神经科学,计算 ...

撰文:知否 IF:38.6 推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐ 亮点: 研究者通过将scRNA-seq技术和VIPER蛋白质活性分析算法相结合,对ccRCC肿瘤组织以及癌旁组织的微环境进行分析,发现了肿瘤细胞特异性的 ...

单细胞RNA-seq数据分析最佳实践（下）