之后宇航员们继续在防疫设施里隔离,接受身体检查和监测,确保他们没有受到任何外星细菌和病原体的影响,包括他们的排泄物都在严格检查后进行了妥善处理,避免外星生物逃到地球环境中。在此期间,检疫设施也接受了世界卫生组织代表的检查。一直到21天后的8月13日,在确信宇航员们没有任何问题后,他们的隔离才宣告结束,开始接受美国民众的欢呼。阿姆斯特朗的生日也在隔离期间度过,期间宇航员们的家人也只能隔着厚厚的玻璃和他们交流。为什么要进行21天的隔离呢?美国宇航局首席历史学家布莱恩·C·奥多姆(Brian C. Odom)说,这是根据当时对人类成为入侵寄主时症状出现所需时间的了解而定的。现在来看,这个时间可能没有什么意义,因为月球上并没有微生物等任何生命,谁知道外星生物入侵地球生命会潜伏多久呢?