单细胞转录组的肿瘤研究3大应用方向等你来攻克
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单细胞文章快讯202108期
本期我们通过PubMed数据库检索,整理了从2021年8月1日到8月31单细胞技术文章共764篇.其中IF (影响因子)大于9分的文章有216篇(文章后面使用表格列出),现选择其中20篇代表性文章进行 ...
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从单细胞水平对乳腺癌代谢分类而治
细胞疯狂生长是肿瘤的共同特征之一,为了有效提供细胞疯狂生长所需的大量能量和大分子,肿瘤需要对细胞代谢和微环境进行重新编程.不过,肿瘤对葡萄糖.脂肪酸和谷氨酰胺等主要能量来源的依赖和利用存在差异,这与基 ...
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单细胞测序探索三阴性乳腺癌治未病
中国最早的医学典籍<黄帝内经>早在两千多年前就指出:圣人不治已病治未病.不过,早期发现癌症的主要障碍之一是我们对肿瘤启动事件了解不足.历来,癌症研究一直集中于已发生肿瘤的组织学和分子学特征 ...
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Cell | 为脑转移免疫治疗提供新靶点!张思园团队揭示中枢神经系统髓系细胞对脑转移的调控作用及机制...
随着对原位肿瘤系统化治疗的发展进步,近年来,继发性的肿瘤脑转移在临床上更趋多见.脑转移的发生发展是转移的肿瘤细胞("the seed" 种子)与中枢神经系统独特的免疫微环境环境(& ...
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单细胞研究(一) | 这些Nature、Cell文章告诉你,如何利用单细胞测序技术研究肿瘤
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单细胞转录组分析肿瘤异质性
欢迎来到医科研,这里是白介素2的读书笔记,跟我一起聊临床与科研的故事, 生物医学数据挖掘,R语言,TCGA.GEO, SEER数据挖掘. 肿瘤异质性指的是不同肿瘤细胞可以表现出不同的遗传和表型特征,包 ...
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肿瘤研究十大标志性事件及靶标:肿瘤的复杂性可以概括成哪些基本机制?
本文来自"CST博士互助平台",文章仅代表作者观点,与"科研圈"无关. <肿瘤的标志性事件>(Hallmarks of Cancer)是由 Robe ...
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科研 | Journal of Hepatology:人肝内胆管细胞癌的单细胞转录组分析和进展机制研究(国人佳作)
编译:逍遥君,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 肝内胆管细胞癌(intrahepatic cholangiocarcinoma,ICC)是肝脏第二大最常见的恶性肿瘤.因此,在单细 ...
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科研 | Circulation:单细胞转录组--心脏研究领域的新发现
编译:杨峰,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 心肌肥厚有时会作为对压力超负荷.容积超负荷或梗死后重塑引起的左心室(LV)壁应力增加的代偿反应出现.然而,在长期的疾病应激诱导的心肌 ...
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科研 | NC:单细胞转录组研究拟南芥早期胚胎发育过程细胞的“命运”(国人佳作)
编译:寒江雪,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 在拟南芥中,受精卵经历不对称的细胞分裂形成了原胚的两种不同的细胞类型,顶端细胞和基底细胞.调控顶端细胞(AC)和基底细胞(BC)发育 ...
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科研 | Cancers:单细胞转录组分析揭示了典型霍奇金淋巴瘤肿瘤微环境中的基于疾病定义的T细胞亚群
编译:艾奥里亚,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 霍奇金淋巴瘤(HL)的特点是该肿瘤微环境(TME)主要由不同类型非癌性免疫细胞和罕见的恶性细胞所主导.细胞成分及其空间关系的表征对 ...
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科研 | Cell Reports: IL-33信号改变支持肿瘤发展的调节性T细胞多样性(单细胞转录组)
编译:杨峰,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 调节性T细胞(Tregs)可损害抗肿瘤免疫反应,并与多种癌症类型的预后不良相关.人类肿瘤中的Treg具有不同于外周Treg的多种转录状 ...
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科研 | PNAS:早期人类糖尿病肾病的单细胞转录组学研究(IF:9.580)
编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 单细胞RNA测序(scRNA-seq)可以量化单个细胞中的基因表达.单核RNA测序(snRNA-seq),已使从冷冻保存的样品中检测稀 ...
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单细胞转录组3大R包之scater
scater 这个R包很强大,是McCarthy et al. 2017 发表的,包含的功能有: Automated computation of QC metrics Transcript quan ...