代谢组、转录组关联分析应用思路 / 开普饭

编译:胜寒,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读人类肠道是一个复杂的.新陈代谢活跃的微生物生态系统.虽然许多研究侧重于单个微生物分类群对人类健康的影响,但它们的整体代谢潜力尚未得到 ...

小太阳编译:小太阳,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读结肠部位的微生物群落可调控众多营养物质复杂的化学转化过程并释放出具有不同生物学效应的代谢产物.但目前对结肠内部纵向代谢动力 ...

本文由董小橙编译,董小橙.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读微生物-肠-脑轴集成了神经,激素和免疫信号,并且对哺乳动物的生长和健康有着深远的影响.一些研究已经表明肠道菌群及其代谢产物广泛参 ...

美国加利福尼亚大学大学圣迭亚哥分校Rohit Loomba教授等人于2019年在<Hepatology>上发表题目为<The intestinal microbiome,plasma ...

编译:寒江雪,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读滥用农用化学品对蜜蜂造成生理和行为伤害,蜜蜂数量急剧下降的问题日益严重.目前草甘膦在农业领域和非农业领域广泛应用,但其对蜜蜂的作用模 ...

编译:微科盟洛雪,编辑:微科盟Tracy.江舜尧. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 导读日常生活中,我们常常会感觉便秘与衰老总是密切相关的,但尚未有相关实验和针对衰老和便秘机制的深入研究.本研究基于 ...

编译:小太阳,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读短链脂肪酸(SCFAs)是由肠道内厌氧菌利用一些难消化的碳水化合物发酵的主要产物.目前已知短链脂肪酸可以改善宿主新陈代谢,但其潜在的 ...

mGWAS (metabolome Genome-Wide Association Study)是将代谢组数据作为表型,与基因型数据进行关联分析的一种领先方法.由于代谢组数据对表型鉴定更为精细,因此关 ...

编译:Mr.Left,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读弱的茎机械强度严重限制了切花的质量,并且通过Ca处理可以缓解弱的机械强度,但是,Ca介导的增强茎机械强度的潜在机制仍然未知 ...

编译:寒江雪,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读枣叶具有很高的营养价值和药用价值.然而,对枣叶中的代谢物缺乏全面的动态的评估.本研究采用超高效液相色谱/串联质谱联用技术,对紫色叶芽 ...

编译:刘娟,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读全基因组关联研究(GWAS)发现多个与血细胞性状相关的基因组位点,这些基因位点的生物学相关性有待研究.研究者整合中性粒细胞基因表达和全 ...

编译:一个矫情的农民,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读花色苷是葡萄中重要的水溶性色素,影响葡萄果实颜色.葡萄的品质,最终也会影响葡萄酒的风味,同时,花青素也是重要的营养成分 ...

本文转载自阅微基因Microread公众号,希望对大家有帮助. 微生物组学&代谢组学联合分析近年来,随着微生物组学研究的不断发展和持续火热,越来越多的研究者跳出单一的微生物研究,开始将微生物组 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 举例展示R语言组学关联分析的方法.宏基因组数据以KO-样品丰度表为例.代谢组数据以metabolite-样品丰度表为例.基 ...

整合高通量组学数据集鉴定潜在机制联系的计算框架 A computational framework to integrate high-throughput '-omics' datasets for ...

分会场报告人郭亮华中农业大学教授.博士生导师.作物遗传改良国家重点实验室固定研究人员.长期从事植物脂质代谢功能基因组学相关研究.2001-2006年先后获四川大学本科和硕士学位,2011年获美国密 ...

之前我们介绍了很多TCGA方面的数据库.其中GEPIA只能用来分析表达数据库各个方面的.cBioPortal可以进行多组学分析,但是一般都是分析自身基因和自身突变等等的关系.至于CVCDAP分析的则是 ...

代谢组、转录组关联分析应用思路