【R数据处理】随机森林机器学习法 / 开普饭

wentao 2021/8/8 写在前面目前patchwork包拼图很不错,我尝试将群落两两比较结果和排序图放到一起看看: 三个样本的排序图置信椭圆绘制这个问题,我来做两个方案: 三个重复的置换检验 ...

写在前面2 今天补充几句话,这部分机器学习的完整内容也会整理到刘老师主编的.实验和分析方法的项目中,这里只是一个引子,供大家理解和学习. 写在前面1 现在机器学习,尤其是随机森林在微生物组学的应用越来 ...

写在前面让点随机排布在一个区域,保证点之间不重叠,并且将点的图层放到最上层,保证节点最清晰,然后边可以进行透明化,更加突出节点的位置.这里我新构建了布局函数PolyRdmNotdCirG 来做这个随 ...

不同域之间的相互关系例如:细菌和真菌,不考虑内部相关,只考虑细菌和真菌之间的相关. 邓老师在前些日子的讲座这提到的这种网络,称之为"二分网络",其实二分网络是我17年听到的一个词 ...

写在前面专辑ggClusterNet包今日开始连载,虽然本包中函数不多,但都是精巧实用之辈.相信可以帮助到大家. devtools::install_github("taowenmicro ...

写在前面多变形排布,将不同的模块按照多变形排布进行.模块越大的部分,其半径越大,是按照模块内节点数量判断到多变形中心的距离. 微生物网络输入文件 #--导入所需R包#------- library ...

00. 写在前面眼下2019年的余额不足一天了,2020年最终还是要到来,首先祝愿大家元旦快乐,其次新的一年祝大家心想事成.说实在的最近老是想出去玩,哈哈哈,文章还没写完,不可以!不可以! 这只是大 ...

RDA环境因子群落结构统计检验可视化环境因子的筛选及数据的转化方面请参阅宏基因组公众号之前的推文,本文主要侧重统计分析与可视化看到师兄文章里的图自己可能用到,想复现一下,于是就尝试了一下,顺便写个 ...

写在前面玫瑰图虽然在疫情数据上有了应用,但是在我们微生物生态领域可以完好的使用,除非你解决一下两个问题: 1 如何让这个圈比较小的部分可以清楚的被标记和识别 2 我不想要一整个圈,来半个圈行不行. ...

写在前面像不像Gephi出图,Gephi布局还是有很多人喜欢,R语言确实不好实现,这个算法需要大量的迭代,让模块化点之间连线最短,不断修正,很耗费时间,我将聚类算法和修改后的距离算法合并起来并结合节 ...

之前我便说过,16s出图主要是用R,自这两年来Y叔的ggtree出来,好评不断,引用不断攀升这里当然借用Y树的包来做我们的进化树,当然Y叔公众号讲的更加深入和详细,有需要请关注:biobabble ...

写在前面算法肯定不同,功能相近. 时间戳:现在2020年8月8日,我在上周便构造了这个函数,用于模仿cytoscape网络的矩阵布局.类似下图的样式. 但是我觉得这个算法我写的不够完善,后面应该还会 ...

写在前面多边形排布,将不同的模块按照多边形排布进行.模块越大的部分,其半径越大,是按照模块内节点数量判断到多边形中心的距离.说通俗一点,就是这个函数可以根据模块节点多少设置合适的大小展示,并且不会重 ...

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