scRNA-seq marker identification(一) / 开普饭

撰文:知否 IF:38.6 推荐度:⭐⭐⭐⭐⭐ 亮点: 研究者通过将scRNA-seq技术和VIPER蛋白质活性分析算法相结合,对ccRCC肿瘤组织以及癌旁组织的微环境进行分析,发现了肿瘤细胞特异性的 ...

病毒工具使神经生物学家可以方便地实现细胞特异性地环路追踪和操控. 最近,艾伦脑科学研究所的Bosiljka Tasic团队在 Neuron 杂志在线发表了题为"Enhancer viruse ...

编译:贤,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肾脏是具有许多不同功能且高度复杂的器官,肾小球和肾小管是肾单位的重要组成部分:这些结构的功能复杂性可能与其不同的细胞类型有关.目前已有研 ...

编译:刘娟,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞水平的分子异质性研究技术加深了我们对包括动脉粥样硬化斑块在内的组织中细胞生物多样性的了解.现有的商业化系统能从成千上万个单细胞中 ...

编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞RNA测序(scRNA-seq)是研究脑和中枢神经系统(CNS)中单个细胞转录组的一种有前途的方法.这项技术充当了神经科学,计算 ...

导读: Immunophenotyping of COVID-19 and influenza highlights the role of type I interferons in develop ...

编译:Tigobin,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 确定实体肿瘤的复杂成分是了解肿瘤发生.发展和转移的基础.虽然患者来源的样本提供了有价值的观点,但它们在多个分子水平上存在异质性,而 ...

回顾单细胞RNA-seq分析介绍单细胞RNA-seq的设计和方法从原始数据到计数矩阵差异分析前的准备工作 scRNA-seq--读入数据详解 scRNA-seq--质量控制为什么需要Norm ...

免疫荧光技术(Immunofluorescence technique )又称荧光抗体技术,是标记免疫技术中发展最早的一种.它是在免疫学.生物化学和显微镜技术的基础上建立起来的一项技术.很早以来就有一 ...

Immune escape and low response to immunotherapy are crucial challenges in present lung cancer treatm ...

首先我们再来看看'market'这个单词. market 英 [ˈmɑːkɪt] 美 [ˈmɑːrkɪt] n. 集市;市场;商场;交易;买卖;交易量;商品的销售地;行销地区;消费群体 v. ...

正文处理原始scRNA-seq数据 3.3 文件格式 3.3.1 FastQC FastQ是您将遇到的最原始形式的scRNASeq数据.所有scRNASeq方案都使用配对末端测序进行测序.Barco ...

拟时(pseudotime)分析,又称细胞轨迹(cell trajectory)分析,通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹或细胞亚型的演化过程,在发育相关研究中使用频率较高.主要基于关键基因的 ...

肿瘤标志物(tumor marker,TM)很多,但每个指标什么意义,那个适用于什么肿瘤呢?下面对其进行了总结,希望对大家有所帮助. 一些常见.通用的肿瘤血清 TM CEA(癌胚抗原) 空腔脏器来源, ...

早在2000年前,我们的祖先发现在某些重大传播疾病幸存下来的人,会获得对这种疾病的抵抗能力,这称为免疫. 免疫功能是由机体的免疫系统来执行的,免疫系统包括免疫器官.免疫细胞和免疫分子,其中免疫细胞在抵 ...

文章是 Batch effects and the effective design of single-cell gene expression studies, 做了不少工作,不知道为什么要发表在 ...

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