人类肠道菌群参考序列数据库 / 开普饭

撰文|王聪编辑|nagashi 排版|水成文人类和其他哺乳动物一样,身体被包括细菌.病毒和真菌在内的数万亿微生物占据,这些微生物被统称为共生菌群.从某种意义上来说,"人"是一个 ...

推荐:江舜尧编译:罗睺编辑:十九美国纽约哥伦比亚大学系统生物学系Harris H.Wang & Dennis Vitkup等人于2019年7月15日在Nature Methods 发表题 ...

本期带来一篇近日发表在Cell上的佳作,该研究整合了迄今为止最全面最完整的人类肠道噬菌体基因组数据库高质量.大规模的噬菌体基因组对后续病毒组学的研究方向产生了重要影响. 精彩的数据分析.流畅的研究思路 ...

人类的肠道是一个非常复杂的生物环境.除了细菌外,数十万种称为噬菌体的病毒也可以在其中生活,它们也会感染细菌.肠道微生物组是人类健康的重要因素,肠道微生物组的失衡会导致疾病和复杂的疾病,例如炎症性肠病, ...

编译:逍遥君,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肠道微生物组的胆汁酸代谢对宿主健康同时发挥有益和有害的作用.启动胆汁酸代谢的微生物胆盐水解酶(BSHs)对宿主生理表现出积极和消极 ...

链读测序(Linked-read sequencing)通过将相同的barcode与长DNA片段(10-100kb)的序列连接在一起,能够消除其中的一些错读,从而改进宏基因组组装.但目前还不清楚在使用 ...

编译:阿昊,编辑:谢衣.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读酸枣叶(Ziziphi Spinosae Folium),是酸枣Ziziphus jujuba Mill. Var. spinosa ...

编译:红皇后,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读由抗生素抗性细菌引起的感染是公众健康的重要威胁,导致这些感染的致病菌会通过被称为水平基因转移(Horizontal Gene Tr ...

编译:团子菌,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读虽然已有研究表明人体健康受到肠道菌群的影响,但宿主-微生物潜在交互作用机制仍然不清楚.而将宏基因组运用于临床研究可以通过揭示可区分 ...

2019年2月11日英国学者Robert D. Finn等人在<Nature>上发表题目为<A new genomic blueprint of the human gut micr ...

婴儿微生物群落的建立过程就是一个"播种-施肥"的过程,如果说分娩过程是一个主要的"播种"过程,那么哺乳过程无疑就是重要的"施肥"过程. &q ...

编译:流年梦,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读全面.高质量的参考基因组对于人类肠道菌群的功能特性和分类学分配研究至关重要.该研究提供了统一的人类肠道微生物基因组(UHGG)数据 ...

第1733期:今日Cell:迄今最大人类肠道噬菌体数据库发布本期话题:肠道噬菌体,瘤内菌群,猪肠道微生物组,三代测序,新生儿,城市化,农药残留,糖尿病展开 02月19日 Cell:迄今最大的人类肠 ...

编译:微科盟R.A,编辑:微科盟木木夕.江舜尧. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 导读人肠道栖居着细菌为主的多种微生物,通常被称为肠道微生物群.肠道微生物群人类生理过程中的参与分子信号传导,被认为对 ...

编译:莫莫,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肾功能衰竭患者表现出的尿毒症症状,可能是由肠道微生物引起的.本研究旨在探讨终末期肾病(ESRD)患者肠道微生物组分.尿毒症毒素与肾功 ...

人类肠道菌群参考序列数据库