TCGA肿瘤微环境数据实在也太简单了
相关推荐
-
你还在使用CIBERSORT内置的LM22免疫基因集
以前我只知道 CIBERSORT 里面是内置了LM22基因集,CIBERSORT是2015年在Nature Methods发表的一个方法,工具在:(http://cibersort.stanford ...
-
在鉴别肺腺癌患者与预后相关 immune signatures
Systematic profiling of immune signatures identifies prognostic predictors in lung adenocarcinoma 在鉴 ...
-
estimate或者CIBERSORT结果真的是很好的临床预后指标吗
肿瘤免疫微环境我们讲了很多内容了,目录是: estimate的两个打分值本质上就是两个基因集的ssGSEA分析 针对TCGA数据库全部的癌症的表达量矩阵批量运行estimate 不同癌症内部按照est ...
-
来了来了,单细胞纯生信数据挖掘全新思路!
今天要给大家分享的这篇文章是今年9月底发表在Aging-US(IF=4.831)上的一篇纯生信分析文章("Glioblastoma cell differentiation trajecto ...
-
明码标价之公共数据库探索
众所周知,肿瘤的TNM分期是目前临床上比较常用的分期方式之一: 其中的T代表的是肿瘤原发灶,其中包括原发灶的部位.大小.数目.侵犯的范围.浸润的深度等 而N代表的是转移淋巴结,包括转移淋巴结的数目.大 ...
-
生物医学大数据挖掘分析
随着高通量测序技术的迅猛发展,各种生物医学数据库应运而生,大数据挖掘技术已成为生物医学领域中最新最重要驱动力之一.GEO是当今最大.最全的公共基因数据资源库,包括基因的表达.突变.修饰等信息,涵盖几乎 ...
-
北方的花卷馒头,两种手法教您在家轻松做出来,实在是太简单了!
美味小舍:今天教在家做出北方人几乎天天都在吃的花卷馒头,做法简单,大家一看就能学会.按照我这个方法做出来,保证每个人看了都可以学会.做出来的花卷层层松软,不仅漂亮而且还很好吃. 美味小舍:今天教在家做 ...
-
maftools|TCGA肿瘤突变数据的汇总,分析和可视化
本文首发于公众号"生信补给站",https://mp.weixin.qq.com/s/WG4JHs9RSm5IEJiiGEzDkg 之前介绍了使用maftools | 从头开始绘制 ...
-
TCGA肿瘤微环境+免疫细胞浸润纯生信思路
研究背景: 越来越多的证据表明,肿瘤微环境在肿瘤的发生和发展中起着重要作用,并且还可以影响患者的预后. 研究方法: 在这项研究中,我们通过分析肿瘤样品的免疫和基质评分以检测差异表达基因(,筛选了乳腺癌 ...
-
熏鱼,好吃的熏鱼自己在家做,再也不用去买,实在是太简单啦!
熏鱼,好吃的熏鱼自己在家做,再也不用去买,实在是太简单啦!
-
看吧,用这个方法发SCI实在是太简单了
本课程采用临床数据结合当前研究热点进行数据挖掘,提供一篇3+SCI范文作参考,这是比较真贵的套路,也是比较新颖的套路,相关的视频我们都已经录制好了
-
一个人越来越有钱的五个习惯(实在是太简单了!)
文/欣儿 钱乃身外之物,生不带来,死不带去,但却在生活中扮演着重要的角色. 就像<仙剑奇侠传>中的"有钱能使鬼推磨",虽有些搞笑,但却是有几分的道理. 正如卢梭说的:& ...
-
Excel列太多录入数据困难?学会数据模板录入,简单的让你吃惊
Excel列太多录入数据困难?学会数据模板录入,简单的让你吃惊
-
1碗面粉3个鸡蛋简单做出小零食,做法简单易学,实在是太好吃了
1碗面粉3个鸡蛋简单做出小零食,做法简单易学,实在是太好吃了
-
《细胞》子刊:免疫治疗新突破!科学家分析超10000例癌症患者的转录组数据,发现4种肿瘤微环境亚型,...
免疫治疗已经大大改变的抗肿瘤治疗的格局. 但不可否认的是免疫治疗需要解决的问题还有很多,最急迫的一个就是准确分辨能够从免疫治疗中获益的人群. 对PD-L1.TMB.微卫星不稳定等生物标志物的探索尚不足 ...