宝藏：TCGA任意基因任意肿瘤，随意分析（附数据和代码） / 开普饭

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2533天 7+纯生信ceRNA文章复现在pubmed搜索ceRNA,发现很多实验类的文章,做了很多内容,但是只发了2-3分,所以今天想和大家一起学习2021年1月发表于 ...

白介素2的读书笔记,分享临床科研干货,一起见证时间的力量 [科研绘图需求点我][付费精品合集][SEER点我] [临床预测模型专辑点我][生物信息数据库挖专辑点我] [临床数据挖掘专辑点我][SEER ...

最近写了一段代码,基于肿瘤TCGA数据库进行一系列分析.只要输入基因名,就可以得到以下结果(注意:只能是mRNA的gene symbol) 1 泛癌表达:该基因在33种肿瘤中的表达 2 差异表达:肿瘤 ...

编译:小北,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞RNA测序(scRNA-seq)是定义肿瘤细胞多样性的有力工具,但是其在解剖免疫调节疗法的基本机制上的应用仍然缺乏.研究者利用 ...

成天在PubMed上冲浪,随便搜了一篇m6A甲基化的文献 .说实话,虽然只是11.164分的 J Exp Clin Cancer Res上的文章,但其实标题还是有点吸引人的,因为有这么一个ALKBH5 ...

Profiles of prognostic alternative splicing signature in hepatocellular carcinoma肝细胞癌选择性剪接预后特征的概述一. ...

学徒和学员已经陆续出师,是时候把生信技能树的舞台交给后辈了! 下面是<生信入门第6期>学员的分享呃提笔来写这个总结,貌似是上周发生的事了,但是不太想回忆,学习新东西会抱着满满的热情,但是 ...

编译:思越,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读转移性结直肠癌的免疫治疗仅对具有高微卫星不稳定性的错配修复缺陷肿瘤有效,并表现出免疫浸润,这表明肿瘤细胞可以决定其免疫微环境.为了理解 ...

Highlights 单细胞RNA-seq分析说明了在人类和小鼠的结直肠癌中存在保守的骨髓细胞子集. 两个完全不同的巨噬细胞各自显示了炎症和生成血管特性. 两个不同的巨噬细胞对CSF1R blocka ...

NLRP3炎症小体可通过调节宿主免疫从而影响免疫治疗反应,是肿瘤发展过程中的一把双刃剑.然而,现代研究仍缺乏对人类癌症中NLRP3炎症小体相关基因在癌症免疫治疗(CIT)反应中的系统评估.因此,在这项 ...

或许高中知道gene,和一些粗浅的概念,比如基因,是遗传信息的载体上了大学,遗传学课上, 基因,是孟德尔的大A 小a 大B 小b 后来,刚进实验室的时候,接触了PCR,接触了基因克隆,定量表达, ...

宝藏：TCGA任意基因任意肿瘤，随意分析（附数据和代码）