Plant Biotechnol. J|OsTPR的优势等位基因导入到优良材料中，从而提高了高直链淀粉背景下的产量

为了解决亚洲未来的粮食安全问题，我们需要在确保消费者接受的同时，提高粮食产量的遗传增益。本研究旨在通过对310份不同栽培稻品种的遗传变异分析，找出影响穗枝梗数（USRB，upper secondary rachis branches）的新基因，从而在不影响籽粒品质的前提下提高优质籽粒。

利用单基因和多基因座全基因组关联研究(GWAS)、基因集分析和基因调控网络分析的籼型品种。通过对USRB（穗枝梗数）的GWAS分析，在1号和2号染色体上发现了230个显著(Q值为0.05)的SNPs。

图1 OsTPR非同义SNP与某些与产量和品质相关的性状关联

通过基因集分析缩小了GWAS的目标范围，发现了编码核孔锚蛋白(OsTPR)的一个重要位点LOC_Os02g50790/LOC_Os02g50799上存在较大的效应关联(LOC_Os02g50790/LOC_Os02g50799)。OsTPR中发现的来自非同义SNPs的优势单倍型与USRB的增加具有特异性相关，优势粒为低垩白度。

通过单倍型挖掘，我们进一步证明了OsTPR的优势等位基因在低血糖指数(GI)的优良材料中提供额外产量优势的协同效应。

我们利用重组自交系群体进一步验证了OsTPR的重要性，将OsTPR的优势等位基因导入到优良材料中，从而提高了高直链淀粉背景下的产量。这证实了OsTPR在影响产量的同时保持谷物和营养品质的关键作用。

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