点点鼠标 - 构建进化树 - 调用IQ-TREE在超短时间ML / 开普饭

为什么要转化聚类结构和树结构呢? 因为通过聚类,通过矩阵计算出来的树和基于进化距离做的树结构其实是相似的,借助于ggtree也好还是其他可用于树结构可视化的分析也罢,都可以进行很好的展示,所以在这里我 ...

进化树以树状结构形象的展示各个节点的进化关系,在物种进化,亲缘关系研究领域广泛应用.在biopython中,通过Bio.Phylo子模块,可以方便的访问和展示树状结构中的信息 1. 读取文件树状结构 ...

这两年为了吸引人才,全国多地都实行了很多优惠政策.其中人才优先购房,更是多地吸引人才落户的一项重要政策. "买卖"购房资格也成了一部分人的歪财路 "我随意点点鼠标,就能 ...

贝叶斯分析方法(Bayesian Analysis)是一种计算假设概率的方法,这种方法是基于假设的先验概率.给定假设下观察到不同数据的概率以及观察到的数据本身而得出的.其方法为,将关于未知参数的先验信 ...

看到同事点点鼠标就能把表格中一些操作搞定,是不是很羡慕呢? 其实你也可以的,今天阿钟老师整理了一组鼠标操作技巧,看看哪些是你工作中常用的. 说明:鼠标操作有双击.单击,还分左键.右键:以下教程中如没有 ...

[温馨提示]亲爱的朋友,阅读之前请您点击[关注],您的支持将是我最大的动力! 我们都知道,在Excel中合并单元格是个非常闹心的事,合并单元格后进行数据筛选.求和之类操作计算时,往往会出现错误.但合并 ...

Jupyter对于表的处理虽然已经很方便了,但是这还不够,最近看到一个神器叫Mito,它真的是做到了无需写一行代码,而且手动的操作可以自动转换为代码,供后续批量化操作,这简直不要太爽. 一.Mito是 ...

很多同学说到数据比对,第一个想到的肯定是VLOOKUP,但是作为新人,我不会VLOOKUP等函数,这个需求怎么处理呢?是否有点点鼠标就可以搞定的方法,今天我们就来一篇保姆级教程!详细图文,包教包会~ ...

本文有大量的外链,推荐阅读原文代谢组学数据分析简介代谢组学几乎完全不涉及生物信息学最核心的序列比对,包括武汉中科院数物所波谱国重实验室等主流科研机构都是利用化学计量学和多元统计分析方法,对通过核磁 ...

早在2015我就在博客写过一个教程 hpv病毒基因研究调研就是下载全部的HPV病毒的碱基序列后进行多序列比对,然后绘制系统发育树,没想到这就是所谓的基因家族分析,有趣! 正好,就安排公司学习者以此为 ...

写在前面我知道IQ-tree已经有很长一段时间了.不过我一直并没有使用它.主要原因是,常用的快速构建ML树的软件是FastTree,如果要求准确,我会在服务器上使用RaxML.所以是用不到.不过,使 ...

点点鼠标 - 构建进化树 - 调用IQ-TREE在超短时间ML