这3个lncRNA组成的食管癌诊断分类器在tcga数据库能否复现 / 开普饭

作者简介本文作者大可,四川大学华西医院肿瘤中心科研搬砖工,研究兴趣包括机器学习在高维组学问题中的应用,预测模型的开发与验证.已发表多篇生信和机器学习相关sci文章. 责编 | 白介素2 JAMA O ...

GEO is a public functional genomics data repository supporting MIAME-compliant data submissions. Arr ...

要分析测序数据,一般都会想到的是TCGA (当然GEO上也有部分的测序数据).但TCGA上只有肿瘤的相关研究,我们如想要研究其他疾病,甚至研究其他物种的测序数据, 其实可以看点别的,比如上EMBL-E ...

一文学会集美貌与实力于一身的TANRIC数据库嗨,小伙伴们大家好!这里是弘毅专栏~每周一给大家分享一个数据库实操教程! 这次弘毅给大家带来的是一款集lncRNA注释和表达信息.可视化和临床相关分析等 ...

如何利用ICGC数据库来寻找一个突变相关课题昨天我们介绍了ICGC来浏览PCAWG数据的基本功能.昨天的那样介绍,稍微有一些零散,所以我们可以假设一个例子来使用ICGC数据库分析一下看一看. 以下是 ...

在ncRNA还没有研究之前,好多表达谱芯片是没有ncRNA的注释信息的.这也就导致说很多表达谱的芯片,没办法分析ncRNA.对于芯片的探针而言,可以通过重注释的办法来看一下是否能重新获得一部分ncRN ...

miRTarBase miRTarBase(http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/index.php)也是一个基于实验基础的 miRNA 绑定基因查询数据库.不同 ...

最近看到某公司宣传他们的科研服务产品,是miRNA的芯片,而且文章居然是2011发表的,那个时候我还不知道生信是啥子.(我一直以为自己足够老了) 该研究使用的是 CapitalBio 平台 (Capi ...

相关作者:吴刚孙震薛润国苏彬姜鸿雁导读 1994年,Inoue等人发起了对浅表食管癌的扩大内镜研究.将不能正常观测可观察到的内窥镜专用机已被初始使用,并且能够从普通观察到放大观察进行连续执行 ...

<2021 CSCO 食管癌诊疗指南>已正式颁布,指南的病理诊断部分增加了评估 PD-L1 表达的推荐等,以期为临床诊疗提供更多依据. 无症状健康人群的食管癌筛查 a. 若内镜下未见病灶, ...

食管癌在男性中的发病率是全女性的三到四倍,但在女性中发病率仍然很高.除了外在的环境因素外,性别特异性的内在遗传因素的对女性食管癌的发病也起到了关键作用.近日,来自苏州大学医学部周翊峰课题组的研究人员发 ...

咱们<生信技能树>的B站有一个lncRNA数据分析实战,缺乏配套笔记,所以我们安排了100个lncRNA组装案例文献分享,以及这个流程会用到的100个软件的实战笔记教程! 下面是100个l ...

不想错过界哥的推送? ↑戳上方蓝字"医学界影像诊断与介入频道"关注我们干货满满,值得收藏! 作者|关关来源|医学界影像诊断与介入频道 1 食管癌有何病因? 过度饮酒.吸烟.营养 ...

[病史临床]男,63岁,胸痛,进行性吞咽困难伴消瘦20天. [影像图片] [影像表现] CT:表现现为食管壁明显增厚,管腔狭窄:食管与周围结构分界不清食管吞钡:食管中段充盈缺损,管腔不规则狭窄,管壁僵 ...

概述鳞状细胞癌是世界范围内食管癌的主要组织学类型.亚洲(中国.哈萨克斯坦和日本)和东非是发病率最高的地区.吸烟.饮酒是食管鳞状细胞癌的明确危险因素.由于这些明确的危险因素的存在,因此可以对高危人群进 ...

食管癌的诊断与治疗 [食管癌临床症状] 进食时有梗噎感,咽喉发紧.噎气呃逆.进行性吞咽困难加重,甚至滴水不进.病人消瘦,腹水,甚至恶液质,若癌肿增大,向前压迫喉返神经,可出现声嘶.呼吸困难:若通过淋巴 ...

这3个lncRNA组成的食管癌诊断分类器在tcga数据库能否复现