今天文章重点:实用!(6-11分SCI都偏爱这个Style)
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综述 | DescribePROT:氨基酸水平蛋白质结构和功能预测数据库
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最强攻略4:史上最全甲基化表观调控数据库汇总解读
表观遗传(Epigenetics)是指DNA序列未发生变化,但基因的表达却发生了可遗传改变.表观遗传学是指基于非基因序列改变所致基因表达水平变化,如DNA甲基化和染色质构象变化等:表观基因组学(epi ...
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AnimalTFDB:动物转录因子注释和预测tool
AnimalTFDB是一个全面的数据库,有经过鉴定.分类和注释的97个物种全基因组水平的125,135个TF基因和80,060个转录辅因子基因,由华中科技大学郭安源教授团队建立并维护其中,根据转录因子 ...
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m6A在线预测网站——SRAMP
点击"Prediction"按钮 选择预测的模型 左边的"Full transcript mode"在对编码和非编码RNA进行预测时,建议使用此模式. 注意,在 ...
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YM500v2:用于人类癌症miRNA研究的小型RNA测序数据库
YM500v2是用于个人smRNA-seq数据集的miRNA定量,是miR鉴定和新型miRNA预测的集成数据库.YM500v2中包含了YM500之后开发的与miRNA相关的新算法,更重要的是,纳入了8 ...
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基于序列分析的m6A数据库简介
基于基因序列来进行预测的数据库,一般的输入文件都是序列文件.序列文件的话一般都是 fasta 的文件格式,文件格式就是下图这种的. 这个文件主要包括两个部分: 第一行,注释信息.这个注释信息我们可以自 ...
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m6A RNA 甲基化位点在线预测-m6AVar
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说起RNA甲基化,在调控基因表达.编辑.稳定性及降解等方面扮演重要角色,相比于 DNA 甲基化,RNA甲基化显得更加复杂,普遍存在于各种生物中.主要包括m1A.m5C.m6A及m7G等.其中m6A甲基 ...
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不容错过的RNA-蛋白结合全局预测数据库,快来试一下吧
解螺旋公众号·陪伴你科研的第2573天 RNAct数据库你的不二选择 蛋白质与RNA的相互作用与许多生理作用和疾病有关.目前,约1400种人类蛋白质具有RNA结合活性的实验证据.但是,在这些蛋白质中只 ...
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RNA甲基化靶标预测
之前我们推荐过一些和RNA甲基化有关的数据库.其中当时总结了四个基于测序来预测RNA甲基化靶标的数据库.前段时间想查一下相关靶标的时候,发现这四个数据库都成了这个样子了.... 另外随着时间的推移会有 ...