下一代感染性病原体测序
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积极推动全球水质与公共卫生安全的女性代表—Joan Rose教授
女性在各行各业担当领袖角色已经越来越常见,国际水协会的现任主席Diane D'Arras就是其中的代表.但是,在国际行业大奖中女性获奖的比例仍相对较低,以新加坡的李光耀水奖为例,目前的获奖个人均为男性 ...
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技术解读 | DNA甲基化在重头甲基转移酶远古丢失后数百万年的进化持久性
胞嘧啶甲基化是DNA中广泛存在的一种修饰,发挥重要的作用.在酵母新型隐球菌(Cryptococcus neoformans),CG甲基化发生在富含转座子的重复序列中,而且需要DNA甲基转移酶Dnmt5 ...
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链读测序技术在宏基因组组装研究中的应用
链读测序(Linked-read sequencing)通过将相同的barcode与长DNA片段(10-100kb)的序列连接在一起,能够消除其中的一些错读,从而改进宏基因组组装.但目前还不清楚在使用 ...
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「综述」NGS在感染性疾病诊断中的临床应用
来源:国际呼吸杂志2020年第12期 作者:陈梨 张丽琴 谢超 皖南医学院弋矶山医院呼吸内科,芜湖 241002 通信作者:张丽琴 Email:lizh333333@aliyun.com 摘要 目前复 ...
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Nature子刊:三代测序重构菌株水平宏基因组序列的计算框架iGDA
https://doi.org/10.1038/s41467-021-23289-4 2021年5月24日,美国西奈山伊坎医学院冯智星等在Nature Communications发文题为Detect ...
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真菌基因敲除技术介绍
真菌,复数真菌,是真菌界约144,000种已知生物中的任何一种,包括酵母,铁锈,黑穗病,霉菌和蘑菇.真菌的种类很多,包括粘菌和卵菌(水菌),它们不属于真菌界,但通常被称为真菌. Chromista王国 ...
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科研 | Nature Communication:基于16S rRNA基因测序评估在种水平和菌株水平的微生物组分析
编译:流年梦,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 几十年来,16S rRNA基因一直被用来分析细菌物种分类,但是全长16S rRNA基因的高通量测序在近期才可用. 1. 该研究使用 ...
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综述 | Nature Communications:一类广泛存在于人体肠道的拟杆菌肽毒素
编译:木子依虫,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 细菌通常产生抗微生物毒素以在微生物群落中取得竞争优势.本文利用表型,突变,生物信息学和宏基因组分析研究了由拟杆菌产生的拟杆菌毒素的 ...
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因美纳向全球病原体基因组计划捐赠6000万美元测序设备
来源:生物谷 2021-05-07 12:45 2021年4月28日,因美纳(纳斯达克股票代码:ILMN)携手比尔及梅琳达·盖茨基金会及其他公共和私营机构,承诺为全球病原体基因组计划捐赠价值6,000 ...
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PaperRSS文献速递|优化核酸探针的DNA芯片合成和下一代测序
近年来,寡核苷酸合成和 DNA 测序技术的发展促进了人类基因组测序项目在临床和常规研究中的应用,从而促进了人类健康和我们对人类生物学的理解. 例如外显子组测序. CRISPR 基因组编辑和 MPRA. ...
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《转》访傅启华:下一代测序技术在罕见病分子诊断中的应用
栏目介绍 <转>访是转化医学网的品牌专访栏目,是业内专家.大佬.知名企业智慧交流碰撞的平台,也是促进行业健康发展的重要力量,<转>访致力于打造转化医学领域最知名的专家访谈栏目. ...
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科研 | PNAS:通过下一代测序技术体内mRNA展示技术使大规模的蛋白质组学测序成为可能
编译:苑志宇,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 大规模蛋白质组学方法对于天然细胞中蛋白质的功能表征至关重要.但是,蛋白质组学在可扩展性,标准化和成本方面远远落后于基因组方法.在 ...
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Nature子刊| 下一代测序技术助力于风湿病学研究
推荐:江舜尧 编译:美少女 编辑:马莉 美国特种外科医院Laura T. Donlin等学者于2019年4月18日在风湿病学顶级期刊<Nature Reviews Rheumatology> ...
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Nature子刊 | 人类和病原体基因组的联合测序揭示了肺炎球菌脑膜炎的遗传学特征
推荐:江舜尧 编译:微遗传 编辑:董小橙 2019年5月15日纽约大学医学院微生物学系.威康桑格研究所John A. Lees等研究人员在著名期刊<Nature Communications&g ...
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单细胞测序助力研究宿主细胞和病原体之间的关系
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脑脊液二代测序技术提高神经系统感染性疾病诊断水平
本报讯 (记者 王晶)北京协和医院神经科自2014年起与华大基因研究院合作,在国内首先开展脑脊液二代测序,用于中枢神经系统感染性疾病的病原体筛查,为一系列疑难病例的病原学诊断提供了重要参考依据:依靠院 ...