CNS图表复现06—根据CellMarker网站进行人工校验免疫细胞亚群 / 开普饭

Nature Communications [IF:12.121] Prox1-positive cells monitor and sustain the murine intestinal epi ...

Intracytoplasmic sperm injection, or ICSI, is a form of in vitro fertilization in which fertilizatio ...

From at least the time of Hippocrates, biologists have been transfixed by the mystery of how a singl ...

Allergens, like pollen, are nothing more than foreign plant antigens. The stimulus for sneezing gets ...

背景:黏膜相关不变性T(MAIT)细胞是半不变性T细胞,其识别高度保守的MR1分子呈递的微生物抗原. MAIT细胞主要位于肝脏和屏障组织中,是抗微生物防御的有效效应物. MAIT细胞在出生时很少, ...

我们都知道,细胞标志物是我们用来对细胞定义和分选的重要标志.当我们想查看某细胞的标志物时,不可能对所有细胞都进行测序分析,首先,经费就烧不起...... 所以,今天小编就给大家介绍一个特别优秀的数据库 ...

# 背景介绍细胞标志物(Marker)是我们用来对细胞定义和分选的重要标志.在进行单细胞转录组数据分析时,非常关键的一步是根据细胞的特征性基因和特征性生物学功能去定义每一个细胞亚群.但是,有些时候, ...

上个月我们组建了:<单细胞CNS图表复现交流群>,见:你要的rmarkdown文献图表复现全套代码来了(单细胞),也分享了单细胞转录组数据分析的流程: 祖传的单个10x样本的seurat标 ...

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回顾我们的CNS图表复现之旅已经开始,前面3讲是: CNS图表复现01-读入csv文件的表达矩阵构建Seurat对象 CNS图表复现02-Seurat标准流程之聚类分群 CNS图表复现03-单细胞区 ...

回顾我们的CNS图表复现之旅已经开始,前面4讲是: CNS图表复现01-读入csv文件的表达矩阵构建Seurat对象 CNS图表复现02-Seurat标准流程之聚类分群 CNS图表复现03-单细胞区 ...

正文文章的第一次分群按照 : immune (CD45+,PTPRC), epithelial/cancer (EpCAM+,EPCAM), stromal (CD10+,MME,fibo or C ...

正文文章的第一次分群按照 : immune (CD45+,PTPRC), epithelial/cancer (EpCAM+,EPCAM), stromal (CD10+,MME,fibo or C ...

正文文章的第一次分群拿到了epithelial cells [n = 5,581], 我们的CNS图表复现拿到的上皮细胞数量是: > table(sce@meta.data$immune_an ...

前言前面我们提到了:CNS图表复现10-表达矩阵是如何得到的,有粉丝提问,既然都开始走RNA-seq数据的上游分析了,到Linux服务器操作了,难道仅仅是为了拿到表达矩阵文件吗?RNA-seq数据分 ...

前言前面的教程里面,我们首先根据 CNS图表复现08-肿瘤单细胞数据第一次分群通用规则进行了初步分群,如下所示: immune (CD45+,PTPRC), epithelial/cancer (E ...

CNS图表复现06—根据CellMarker网站进行人工校验免疫细胞亚群