手把手教三种信号通路可视化方法 / 开普饭

mapman 植物基因功能分析神器!(mapman系列之一) 说在前头作为一个老牌的专门针对植物学研究开发的通路分析的软件,mapman,似乎在当前大多数组学分析的流程中被忽略,而只能在相对少数文 ...

昨天我们介绍了两个基于现成数据库来可视化通路的工具.同时也说到这两个工具有两个不好的地方:1. 数据结果到处是png格式的:2.通路会显示所有相关的基因,有可能会造成可视化信息的混淆.这个时候其实最好 ...

GSEA(Gene Set EnrichmentAnalysis),即基因集富集分析,无需设定阈值来区分上调下调基因,使用所有的基因进行分析. GO 和 KEGG 可参考:R|clusterProfi ...

在昨天介绍的KEGG数据库当中,我们可以看到,对于基因通路的可视化,最简单的就是通过类似流程图一样的形式来进行可视化的.例如下面的自噬通路图.

在文章中,植物激素通路分析常以下面两种形式的图片来展示分析结果.其一,依赖于 KEGG pathway 的通路图,在此基础上将通路中的基因用不同颜色来展示其在转录组数据中的上下调情况. 另外一种类型, ...

信号通路是指能将细胞外的分子信号经细胞膜传入细胞内发挥效应的一系列酶促反应通路.细胞信号通路图是科研研究过程中最常见也是最常用到的,如何绘制适合我们自己科研课题的信号通路图呢?可以试试 pathway ...

修行交流加道长私人微信:309658338 风水简单来说就是我们的居住环境,其产生的气场对我们人体气运的生旺和克制的表现.而家庭作为我们作息的场所,必须符合风水之道,才能给自己带来好运,否则即使将家 ...

恋爱的年纪里,爱意随风而起. 许多人还没做好准备,就在某个人生的转弯处,邂逅让自己心仪的对象. 一旦爱情入了心,对方的身影,就会在脑海中扎根,无论你使出浑身解数,都无法将其赶走:唯一能做的,就是放任自 ...

老员工陈先生在一家互联网公司工作了5年的时间,其实他觉得和老板的关系还是很不错的.前不久,老板竟然在公司会议上提议,把公司员工的双休改成单休,并且给员工每个月加200元的工资,对此很多员工都怨声载道, ...

炒糖色就是利用糖经过炒制过程中使食物呈现的一种颜色.炒糖色时油的用量不能大,只是起到润锅的作用即可.清水的用量应该跟白糖差不多,或者略少. 一般来说就是最后几秒有点儿难掌握,其实就是火候难,早了糖没融 ...

没有相欠,又怎会遇见? 碌碌红尘中,两个人的相遇,犹如命中注定的一般.如若彼此有缘,即使相隔千里之外,也阻挡不住双方奔赴的热情:如若无缘,相逢对面也不会相识. 缘分的趋势下,我们在情不自禁中爱上一个人 ...

手把手教三种信号通路可视化方法