多个gsea数据集整合为什么一定要纠结批次效应 / 开普饭

范振海邢时云冯源 [摘要]目的:采用生物信息学方法筛选出肝癌的关键差异表达基因.方法:对GEO公共数据库中获取的四组肝癌和癌旁组织基因表达芯片数据进行生物信息学分析,首先用R数据包中的limma程 ...

昨晚的送书活动今晚24点结束哦!今天该来学习新知识啦!咱们看看19年11月发表在Aging (Albany NY)(IF:5.515)上这一篇文章,"Identification of mo ...

导语今天和大家分享的是2019年11月发表在Frontiers in Genetics杂志(IF=3.517)上的一篇文章,"Identifying Key Genes and Funct ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2618天非肿瘤多数据集联合分析在进行生信分析的时候,如果搜索到好几个GEO数据集,不知道大家有没有这些困惑: 多个GEO数据集,应该分别分析,还是合并以后再一起分析呢 ...

GSEA(Gene Set EnrichmentAnalysis),即基因集富集分析,无需设定阈值来区分上调下调基因,使用所有的基因进行分析. GO 和 KEGG 可参考:R|clusterProfi ...

Computational Detection of Breast Cancer Invasiveness with DNA Methylation Biomarkers用DNA甲基化生物标志计算检测 ...

2020年非肿瘤的免疫浸润肯定是一个大热门!还没有做的小伙伴就参考着这篇文章可以开始设计自己的课题了. Elucidating the molecular pathways and immune sy ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读差异表达分析(DE)和基因富集分析(GSE)常用于单细胞转录组研究中.本研究中,作者开发了一种集成且可扩展的方法--iDEA,可通过分 ...

题目:Prognostic Implications of Novel Ten-Gene Signature in Uveal Melanoma 葡萄膜黑色素瘤10基因特征的预后价值摘要背景:葡萄 ...

对于非常大的数据集,标准工作流程可能计算成本高得令人望而却步.在此工作流程中,我们可采用如下两种方法提高效率和运行时间: Reciprocal PCA(RPCA) 基于参考的整合主要的效率改进是使用 ...

▎药明康德内容团队编辑为什么一些新冠病毒感染者在痊愈几个月之后,检测依旧显示阳性?几名科学家有一个看起来很疯狂的想法--新冠病毒会把自己的遗传物质插入到人类的基因组里.今天,<美国国家科学院院 ...

2021年高考即将到来,临近大考的最后一个月,如何复习备考,如何将备考效益最优化,是高三师生最关心的问题.我认为,最后冲刺的一个月,需要各方协同发力,精细规划.如若能科学.精细地做好最后一个月的备考, ...

互联网创业的核心所在,弄明白了你也能成功!

计划成立的太空系统司令部将整合目前负责太空采办的多个机构.太空部队正在推进计划在明年某个时候成立这个职能司令部,以监督重大项目(如卫星,发射服务和信息系统)的研究,开发和采办. 美国太空司令约翰&qu ...

音乐是一种抒发感情.寄托感情的艺术,它以生动活泼的感性形式,表现高尚的审美理想,审美观念和审美情趣.在给人以美的享受的同时,通过熏陶及感染的途径,潜移默化地来影响人的心灵. 全套中国10大名曲,送给大 ...

来源:网易号 iNature前沿从COVID-19恢复后的患者中,已广泛报道了严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2(SARS-CoV-2)RNA的长期检测和PCR阳性试验的复发,但其中一些患者似乎并未 ...

来源:网易号iNature前沿从COVID-19恢复后的患者中,已广泛报道了严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)RNA的长期检测和PCR阳性试验的复发,但其中一些患者似乎并未感染 ...

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