MPB：微生物所东秀珠组-​​基于16S rRNA基因和基因组序列对细菌物种的初步鉴定

相关推荐

• 科研 | AEM：作者解读-大规模分离培养及基因组分析揭示喀斯特洞穴细菌代谢潜力

  编译:微科盟朱海珍,编辑:微科盟木木夕.江舜尧. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 导读 喀斯特洞穴是一种分布广泛的地下生态系统,微生物在推动洞穴发育与元素的生物地化学循环中发挥重要作用.以往的研究通过 ...

• 酸性矿山废水中典型嗜酸菌的代谢与进化

  本周佳作推荐带来一篇mSystems上的研究.研究对矿山废水中典型嗜酸菌的代谢与进化进行了探究,结果显示分离的嗜酸菌主要通过基因水平转移(HTGs)和基因正向选择的机制共同对极端环境产生适应性. In ...

• 科研 | Cell Reports：整合的宏基因组基因集揭示了对小鼠肠道微生物组的新见解

  编译:逍遥君,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 肠道菌群是一个动态的.高度多样化的微生物生态系统,影响宿主生理的许多方面.鸟枪法宏基因组测序等非培养依赖性方法彻底改变了表征和研究 ...

• 技术贴 | 宏转录组专题 | 盘点宏转录组分析方法

  本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 宏转录组 宏转录组测序是对某一特定时期.特定环境样品中的全部微生物的RNA进行高通量测序,直接获得该环境中所有微生物 ...

• 二代测序技术中生物信息学的应用

  随着科学技术的巨大进步,产生了大量的"组学"数据.理解生物系统各个层次产生的大量序列和结构数据是关键,由此产生了"生物信息学". "生物信息学&quo ...

• 科研 | Nature Communication：基于16S rRNA基因测序评估在种水平和菌株水平的微生物组分析

  编译:流年梦,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 几十年来,16S rRNA基因一直被用来分析细菌物种分类,但是全长16S rRNA基因的高通量测序在近期才可用. 1. 该研究使用 ...

• 科研 | Appl. Environ. Microb.：双歧杆菌属的阿莫西林-克拉维酸耐药性

  编译:微科盟艾奥里亚,编辑:微科盟木木夕.江舜尧. 微科盟原创微文,欢迎转发转载. 导读 阿莫西林-克拉维酸(Amoxicillin-clavulanic acid,AMC)是西方世界最常用的抗生素制 ...

• m6A图文复现03-测序数据去除rRNA序列并且比对到参考基因组

  下面是MeRIP-seq 图表复现笔记 在上一期:m6A图文复现02-数据下载和质控 中我们得到了cleandata,接下来是要比对到参考基因上进行比对过程的分析.一般来说,在比对之前,我们可以选择先 ...

• EM | 对欧洲太平洋牡蛎在死亡事件爆发期间病理种群动态的评估：基于16S rRNA基因谱和新型靶向富集NGS测序

  推荐:江舜尧 编译:ye00ye 编辑:十九 意大利热那亚大学地球环境与生命科学系(DISTAV) 的Luigi Vezzulli(通讯作者)等人于2019年7月20日在微生物顶级期刊Environm ...

• MPB：微生物所蔡磊组-​​基于二代测序的真菌基因组组装和注释

  为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

• MPB：水稻根系微生物组研究中的样本种植、取样和16S rRNA基因扩增子文库制备方法

  为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

• MPB：使用QIIME 2分析微生物组16S rRNA基因扩增子测序数据(视频)

  为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

• MPB：中南大学刘学端、马丽媛组-基于16S测序和RT-qPCR的硫化矿物表面微生物群落组成分析

  为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

• 科研 | MT：16S rRNA基因扩增子深度测序揭示挪威水体中与粪便污染有关的水生微生物多样性

  本文由流年梦编译,十九.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 粪便污染是影响水质的关键因素,本研究采集了来自挪威的中等和高等粪便污染的饮用水库支流,受到极度污染的城市小溪以及轻微污染的农村小溪 ...

• MPB：亚热带生态所谭支良组-基于微生物成分数据的差异zOTU分析流程

  为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

• MPB：中科院微生物所蔡磊组-​基于扩增子数据的系统发育树的构建和展示

  为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...