推荐:江舜尧
编译:Frank
编辑:十九
英国卡迪夫大学生物科学学院Sophie E. Watson等人于2019年8月5日在The ISME Journal发表题目为《Global change-driven use of onshore habitat impacts polar bear faecal microbiota》的文章,该文章深入研究北极熊栖息地的改变与其肠道微生物多样性及组成的关系,首次提出全球变化将引起野生动物肠道微生物群落的改变。
文章摘要
肠道微生物群对宿主健康起着关键作用,但目前缺乏对野生物种中肠道微生物的研究。北极熊是北极生态系统健康和环境变化的关键指标,目前北极熊栖息地快速变化,这可能影响其肠道内微生物动态平衡发生改变。海冰缩减导致南弗特海北极熊亚群出现分化,目前越来越多的北极熊在冰层解冻期居住在陆地沿海地区(陆上熊),而其余北极熊继续保持居住在冰上的习性(离岸熊)。研究表明,为应对气候变化而改变栖息地的北极熊,将表现出明显的肠道微生物群落多样性和组成变化,这可能最终对北极熊的健康产生重要影响。本研究使用16S rRNA Illumina技术首次检测野生北极熊粪便微生物的丰度和多样性。研究表明,与离岸熊相比,陆上熊的细菌多样性明显更高。陆上熊丰度最高的OTU为变形菌门,而丰度最低的OTU为厚壁菌门。本研究结论为,气候驱动的北极熊栖息地变化与微生物群落差异具有相关性。通过本项研究,我们首次提出了全球变化介导的自由迁徙型野生动物肠道微生物群的变化。
文章中重要图片说明
图1 | 研究区域地图显示沿阿拉斯加北海岸的112个南波弗特海北极熊的采样位置。
图2 | a.南波弗特海北极熊粪便的微生物群中25个细菌门相对丰度堆积条形图。b.进化热图:从中心向外扩散的每个节点表示不同的分类等级,中心点表示界,边缘节点表示菌目。
图3 | 85个南波弗特海北极熊(离岸熊/陆上熊)粪便微生物群的α多样性小提琴图:a.香农多样性指数。b.反辛普森多样性指数。
图 4 | 根据细菌类别绘制陆上熊和离岸熊粪便微生物群落OTU丰度图。
图 5 | 利用DESeq2分析,通过OTU编号和相关菌科绘制陆上熊与离岸熊差异OTU丰度对比图。
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