总说要挖掘单细胞公共数据，你先用起来可以吗？ / 开普饭

An atlas of the aging lung mapped by single cell transcriptomics and deep tissue proteomics 联合单细胞转录组 ...

北京讯细胞命运或状态由多维度染色质修饰景图及其调控基因表达谱决定.虽然各类组蛋白修饰.转录因子结合等表观因子调控的机制与结果各异,却协同决定了基因的选择性表达.全局性的研究多维度的表观因子相 ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞转录组学为推断细胞网络中配体受体(LR)的相互作用提供了前所未有的机会.本文介绍了一种新的LR数据库和一种新的正规化评分来执行这 ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞转录组学产生了越来越多的数据,其中包含多达数百万个细胞中数千个基因的RNA表达水平.常见的数据分析管道包括降维步骤,用于以二维方 ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读差异表达分析(DE)和基因富集分析(GSE)常用于单细胞转录组研究中.本研究中,作者开发了一种集成且可扩展的方法--iDEA,可通过分 ...

单细胞组学改变了我们对于细胞异质性的研究与其动态重构的理解.多种降维.分群方法的开发可以让我们迅速的分辨出不同的细胞类群.随着研究转向对复杂的人体组织甚至整个生物体的分析,通过大规模的高并行集群运算可 ...

Single-cell RNA sequencing of human kidney 人肾脏的单细胞测序一. 研究背景肾脏是在结构和功能高度复杂的器官,而其结构和功能的复杂性与其众多的细胞类型相关 ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读背景:肾小球是由三种不同的细胞组成,它们分别是系膜细胞.内皮细胞和足细胞.然而,健康肾小球细胞群体中存在的细胞异质性仍是未知的.方法: ...

我列过一个生物信息学入门200篇NGS文献解读计划,其中一个文献是发表于2018的NC,标题是:Unravelling subclonal heterogeneity and aggressive d ...

近年来,随着测序技术的迅猛发展,单细胞测序技术已逐渐走入人们视野.2013年,单细胞测序技术成为<自然>评选的"Method of the Year". 大多数的基于N ...

银行业数字化一周动态百信银行在百度开"数字分行" 发布全能数字银行卡 8月15日,"超乎于新-百度闪付卡产品发布会"在京举行.百度闪付卡是由百度.百信银行联 ...

100年前,嘉兴南湖的红船上,一名身穿杏红色旗袍,撑着油纸伞的年轻女子正襟危坐在船头.偶有其它船只经过时,她会唱起嘉兴小调,轻轻敲打着木栏来警示船内的人. 旁人都未曾料到,游船内,中共一大的闭幕会议正 ...

RNA-seq这样的测序数据也可以的啊! 比如这篇Published: 12 March 2019的文章:Identification of Key Long Non-Coding RNAs in t ...

最近各个公众号都在鼓吹单细胞转录组数据套路,感觉这样的科研风气不好,数据挖掘这个技能最大的作用应该是避免大家重复浪费科研经费去做一些明明可以通过分析公共数据库拿到的结论! 比如你研究的癌症里面哪些基因 ...

看过单细胞水平的癌症研究的朋友都应该是对下面这样的图不陌生: 可以很清晰的看到,多个病人的单细胞可以分成恶性的上皮细胞和非恶性的肿瘤微环境,微环境的那些细胞可以聚集成为很多类,而且每个类别的细胞都是来 ...

导语今天和大家分享的是今年7月份发表在Cancer Immunology, Immunotherapy 杂志(IF=5.442)上的一篇文章,"Integrated analysis of ...

[科研绘图点我][付费精品合集][SEER点我] 本文题为Systematic expression analysis of ligand-receptor pairs reveals importa ...

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