这篇11分文章还留了个宝藏给你 / 开普饭

实体瘤肿瘤特异性免疫预后特征及其与免疫检查点治疗的关系首先让我们通过摘要了解下这篇文章的主要内容,为了阐明免疫细胞浸润作为实体肿瘤预后标志的作用,作者分析了四个公开的单细胞RNA-Seq数据集和TC ...

最近读到发表在nature medicine杂志的文章<Immune profiling of human tumors identifies CD73 as a combinatorial t ...

编译:Echo,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读纤维化是各种因素(生物因素.化学因素.物理因素等)损伤作用下导致细胞外基质的异常合成增加和(或)降解不足所引起的病理过程,是全球医 ...

生物信息学生R入门教程关于生信,网上的学习资料有很多,初入门的学生,往往迷失在纷繁复杂的教程中,而找不到发力的方向.那么有没有一些整理的比较系统的总结呢,答案是有的.今天我们要给大家分享的就是一个比 ...

编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞RNA测序(scRNA-seq)是研究脑和中枢神经系统(CNS)中单个细胞转录组的一种有前途的方法.这项技术充当了神经科学,计算 ...

生信实操随着测序技术的进步开发了一种单细胞转录组测序(scRNA-seq)技术,单细胞转录组测序技术可以一次检测成千上万个细胞的转录水平,在单细胞水平上检测和定量基因表达水平变化,从而揭示bulk ...

编译:冬日暖阳,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读纤维化主要病理特征是细胞外基质过度积聚,器官组织内纤维结缔组织增多,实质细胞减少,持续进展可导致器官结构破坏和功能减退,乃至衰竭, ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读背景:人体细胞图谱是一项大型的国际合作项目,旨在绘制人体所有细胞类型.单细胞RNA测序可以生成高质量的数据,绘制此类图谱.但是,新鲜样 ...

编译:刘娟,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞水平的分子异质性研究技术加深了我们对包括动脉粥样硬化斑块在内的组织中细胞生物多样性的了解.现有的商业化系统能从成千上万个单细胞中 ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 单细胞技术的进步正在改变我们对细胞身份的理解.例如,单细胞RNA测序和质谱分析技术在研究血液.次级淋巴器官和肾中免疫细胞群的应用中,可以帮助 ...

回顾单细胞RNA-seq分析介绍单细胞RNA-seq的设计和方法从原始数据到计数矩阵差异分析前的准本工作学习目标了解如何导入单细胞rna-seq实验的数据. 质量控制流程在量化基因表达 ...

# 背景介绍单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术是以单个细胞分辨率研究复杂生物的转录组,这种形式能够为科学家研究细胞在表达模式上的异质性,特别是疾病细胞的异质性.scRNA-seq的快速发展为 ...

文章信息文献标题:The triumphs and limitations of computational methods for scRNA-seq 发表时间:2020.06.21 发表杂志:N ...

编译:卡德加,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物功能是单个细胞在不同组织中协同作用的结果.RNA-seq测序技术和组织处理技术的进步使研究者能够捕获单细胞分辨率下的转录变化.单 ...

导语今天和大家分享的是2020年1月份发表在SCIENTIFIC DATA杂志上的一篇文章(IF=5.929)"Single-cell RNA sequencing of human ki ...

编译:阿温,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肺癌是导致癌症患者死亡的主要原因,它表现出的异质性使其具有适应性,限制了治疗的成功,且仍没有被完全了解.本研究采用30名转移性肺癌患者 ...

回顾单细胞RNA-seq分析介绍单细胞RNA-seq的设计和方法从原始数据到计数矩阵差异分析前的准备工作 scRNA-seq-读入数据详解学习目标构建QC指标和相关的图,以直观地了解数据的 ...

编译:贤,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肾脏是具有许多不同功能且高度复杂的器官,肾小球和肾小管是肾单位的重要组成部分:这些结构的功能复杂性可能与其不同的细胞类型有关.目前已有研 ...

编译:小北,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在哺乳动物胚胎形成过程中,差异基因逐步构建起每个组织和器官系统的命运和复杂性.在本文中研究者系统的定量了10.5天胚胎的发育到出生小 ...

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