10X单细胞转录组的测序数据量这么少是为什么 / 开普饭

背景介绍目前,单细胞转录组技术已成功应用于解析肿瘤微环境(TME)中正常细胞和肿瘤细胞的亚群和基因表达.同时,随着高通量测序技术的发展,使并行检测数以万计的单细胞转录组信息也成为可能. 然而,大 ...

一.单细胞single cell RNA-seq简介 1.Bulk RNA-seq(大量RNA-seq) Measures the average expression level for each ...

# 背景介绍单细胞相关的研究数据常常以原始数据的形式存储,由于需要使用复杂的计算流程进行数据处理,生物研究人员很难访问这种格式的数据.虽然目前已经有一些数据库收集.管理和整合scRNA-seq数据和 ...

推荐:江舜尧编译:多儿编辑:马莉法国图卢兹癌症研究中心学者Jean-Jacques Fourniéa等人于2019年5月22日在<PNAS>上发表题目为<Single-cell ...

浩瀚星空吸引着人们进行探索.在转录组学中,空间分辨率也开辟了新的世界. 导读空间转录组学是单细胞分析后的下一波热潮,这是一个非常活跃的领域,新的技术开辟了新的科研角度.该技术不仅可以获取转录组数据并 ...

Single-cell RNA sequencing of human kidney 人肾脏的单细胞测序一. 研究背景肾脏是在结构和功能高度复杂的器官,而其结构和功能的复杂性与其众多的细胞类型相关 ...

编译:卡德加,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物功能是单个细胞在不同组织中协同作用的结果.RNA-seq测序技术和组织处理技术的进步使研究者能够捕获单细胞分辨率下的转录变化.单 ...

编译:罗睺,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读单细胞RNA测序(scRNA-seq)是研究脑和中枢神经系统(CNS)中单个细胞转录组的一种有前途的方法.这项技术充当了神经科学,计算 ...

推荐:江舜尧编译:多儿编辑:马莉费城儿童医院学者Kai Tan等人于2019年5月7日在<Genome Biology>上发表题目为<SCRABBLE: single-cell ...

编译:小北,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在哺乳动物胚胎形成过程中,差异基因逐步构建起每个组织和器官系统的命运和复杂性.在本文中研究者系统的定量了10.5天胚胎的发育到出生小 ...

编译:夕夕,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读空间分辨转录组学的最新进展极大地扩展了复杂的多细胞生物系统的知识.近年来,该领域迅速扩展,并且已经开发了几种旨在将基因表达数据与空间信 ...

转录组测序技术 (RNA-seq) 具有广泛的应用,RNA-seq数据分析主要步骤包括实验设计,质量控制,reads比对,基因和转录水平的定量,差异基因表达,可变剪接,功能分析,基因融合检测和eQTL ...

10X单细胞转录组的测序数据量这么少是为什么