都可以批量做生存分析了，还要网页工具干嘛？ / 开普饭

在大家进行科研工作的过程中,拿到一个基因,获取表达量后,总要先与预后来一波分析.分析过程中势必会涉及到分组,说到分组,肯定是老生常谈的以中位值,平均值,抑或是3分位数来进行.但是如果这样分组后预后依旧 ...

近年来,免疫检查点抑制剂在各个癌症中都大放光彩,在改善患者的生存和提高患者的临床获益中起到了至关重要的作用.然而,仅有部分患者对免疫检查点抑制剂产生应答,仍存在较多比例的患者对免疫检查点抑制剂无法产生 ...

长期更新列表: 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据(cBioPortal)TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 (离线打包版本)TCGA的28篇教程- 使用R语言的R ...

本文的临床数据的生存分析,并没有使用TCGA数据库里面的病人信息,而是自己收集病人样本,记录其临床信息,随访时间等等.还采用IHC等病理技术手段来量化感兴趣的基因的表达量情况,最后全部使用自己的数据做 ...

有一些五六年前的学生们都成长为了各个生物信息学相关公司的小领导,而且他们都有了自己的公众号,知乎号,也算是一番人物.最近他们跟我反馈面试找不到或者说很难直接考核筛选到认真干活的生信工程师,挺有意思的. ...

很多小伙伴总是担心没有生存时间,做不了生存分析,发不了文章,这种想法是错误的,因为数据挖掘完全可以不做生存分析.今天要分享这篇文章就是没有做生存分析的,作者主要是利用了GEO数据发现了2型糖尿病和结直 ...

首先,我们这里是介绍使用survival这个包来做. 软件的安装:install.packages(survival) 加载包:library(survival) 我们这里利用R自带的数据进行分析. ...

前言年前我提出了一个问题:为什么不用TCGA数据库来看感兴趣基因的生存情况就是一篇文章并没有使用TCGA数据库的指定癌症的生存信息去看自己感兴趣的基因的生存效应,反而舍近求远去下载BMC Canc ...

正式进入寒假,开过家长会,有的老师会把期末试卷发给家长,这样可以清晰地了解孩子都错在哪里了.卷子拿回家,不是让家长揍孩子,而是希望家长能和孩子一起分析分析卷子,究竟都错在哪里了.与分数相比,考试后分析 ...

我们已经多次介绍过生存分析: 集思广益-生存分析可以随心所欲根据表达量分组吗生存分析时间点问题寻找生存分析的最佳基因表达分组阈值 apply家族函数和for循环还是有区别的(批量生存分析出图bug ...

学徒和学员已经陆续出师,是时候把生信技能树的舞台交给后辈了! 下面是<生信入门第6期>学员的分享她上一个笔记是:学徒数据挖掘之谁说生存分析一定要按照表达量中位值或者平均值分组呢? 这次带 ...

都可以批量做生存分析了，还要网页工具干嘛？