对miRNA进行go和kegg等功能数据库数据库注释 / 开普饭

前几天和大家介绍了一下GEO数据库以及使用GEO2R进行差异表达分析GEO2R差异表达分析软件.几乎现在的套路性文章在做完差异表达分析后,都会去做GO和KEGG富集分析.那么GO和KEGG都是什么?富 ...

参考文章题目:Identification of biomarkers and construction of a microRNA‑mRNA regulatory network for clear ...

第一单元 lncRNA数据库长链非编码RNA(Long non-coding RNA, lncRNA)是长度大于 200 个核苷酸的非编码RNA.研究表明, lncRNA 在剂量补偿效应.表观遗传调 ...

SomamiR是microRNA(miRNA)及其靶点中癌症体细胞突变的数据库,集成了多种类型的数据,用于研究体细胞和种系突变对癌症中miRNA功能的影响.数据库还提供了存在miRNA靶序列体细胞突变 ...

编译:李可爱,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读随着基因序列数据量的迅速增长,科学家面临着巨大的任务.目前,2020.04版本的UniProt数据库中,从功能和结构上表征新型蛋 ...

机电商品的理论研究有时会涉及多功能机器定义的讨论(例如,多功能机器与组合机器的异同),此时除了第十六类注释三所称"具有两种及两种以上互补或交替功能的机器",较常引用的还有总注释第六 ...

我们在进行研究一个基因之前都要了解这个基因主要是功能是什么,或者它可能的功能是什么.如果要了解一个基因目前的功能的话.可以通过genecards来查找的. 如果想要挖掘这个基因额外的功能的话,那就需要 ...

说起lncRNA,想必大家不会陌生,作为不同的生物学过程中的关键角色,发挥着重要功能,并与许多人类疾病相关,如癌症,心血管疾病和神经退行性疾病等.但是,并非所有表达的lncRNA都具有功能.所以今天小 ...

在基于高通量测序的进行基因功能预测的是时候,我们经常需要寻找符合我们研究疾病的数据集.拿肿瘤而言,最常见的的还是 TCGA 数据库.但是一个数据集进行基因功能预测的时候,有可能在后续的实验的时候就会产 ...

目前大部分lncRNA相关的数据库都是依赖高通量测序,而今天我们介绍的这个数据库以实验验证为基础,收集2016年5月1日前的所有lncRNA实验数据,并整合了lncRNAdb, LncRANDisea ...

昨天我们介绍的融合基因查询的数据库,可以查询发生基因融合的基因.由于发生了基因融合,所以就相当于形成了新的基因,对于这种基因的功能是什么,昨天的数据库没有介绍.今天我们就来介绍用来查询融合基因功能的数 ...

写在前面目前我们用到的很多甲基化的数据库都是基于甲基化芯片来进行检索的.所有的甲基化芯片和表达谱芯片一样都是基于设计序列来进行检测的,类似的我们检测的原始数据是cg开头的ID编号,这个编号代表检测其 ...

本文由沐子星根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 KEGG是1995年由日本京都大学生物信息学中心的Kanehisa实验室建立的,是一个整合了基因组.化学和系统功能信 ...

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