航母级基因功能预测数据库 / 开普饭

"Pan-Cancer Analysis of HumanKinome Gene Expression and Promoter DNA Methylation Identifies Dar ...

今天继续我们TCGA在线数据库系列.今天介绍的数据库是LinkedOmic,http://www.linkedomics.org/login.php可谓是航母级数据库,没有做不到的,只有想不到的.话不 ...

一款操作简单.快速有效的TCGA数据挖掘分析的网站工具---UALCAN . UALCAN (http://ualcan.path.uab.edu/index.html)是一个基于PERL-CGI.j ...

#背景介绍单细胞测序分析可以解决肿瘤异质性的问题,提高实验数据分析的准确性,对临床医生对疾病的诊断.检测.治疗提供非常有价值的帮助,也是现今生命科学研究的焦点.但测序费用的昂贵让很多怀着科研梦想的人 ...

编译:红皇后,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读尽管近些年测序的成本不断的下降,鸟枪宏基因组测序的价格依然要远高于16S rRNA扩增子测序,因此研究人员开发了多种基于微生物群落 ...

KM-plotter(https://kmplot.com/analysis/) 是一个在线进行生存分析的网站,数据最全并且是生存分析最权威的网站.在已发表的论文中,生存分析的数据多来自KM Plot ...

导语表观基因组广泛关联研究(Epigenome-wide Association Study,EWAS),基于全基因组范围寻找组间的表观遗传学标记的差别或特征,能够帮助我们了解表观遗传改变与相关形状 ...

我们在进行研究一个基因之前都要了解这个基因主要是功能是什么,或者它可能的功能是什么.如果要了解一个基因目前的功能的话.可以通过genecards来查找的. 如果想要挖掘这个基因额外的功能的话,那就需要 ...

编译:李可爱,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读随着基因序列数据量的迅速增长,科学家面临着巨大的任务.目前,2020.04版本的UniProt数据库中,从功能和结构上表征新型蛋 ...

在进行肿瘤相关研究的时候,如果有这个肿瘤的随访时间和随访的结局,往往都可以进行预后分析.通过预后分析来了解某一个分组(治疗方式,基因突变,基因表达高低)是否影响肿瘤患者的预后.那么如果在基因研究的时候 ...

昨天我们介绍的融合基因查询的数据库,可以查询发生基因融合的基因.由于发生了基因融合,所以就相当于形成了新的基因,对于这种基因的功能是什么,昨天的数据库没有介绍.今天我们就来介绍用来查询融合基因功能的数 ...

在前几天的介绍当中,我们通过一篇综述了解到了tRNA的功能.其中在那篇综述当中提到了四个和tRNA有关的数据库.但是综述当中介绍的数据库基本上都是用于查询tRFs的基本信息或者查看tRFs在肿瘤当中的 ...

大概有50人加入吧,成功坚持下来的朋友们累积了 200多文献阅读笔记,反而是公众号编辑忙不过来,所以大多数好的笔记无缘跟粉丝见面,不过我自己的笔记可以开绿色通道 Nat Med. 2017 April ...

好啦,小伙伴们,上次咱们刚介绍过神器starbase,那么今天咱们再来学习一下另一款神器:miRWalk(http://mirwalk.umm.uni-heidelberg.de/).在咱们预测的时候 ...

写在前面对于miRNA靶基因的预测而言,目前有很多数据库都可以做.这些数据库的区别基本上在于纳入的数据量以及预测的算法不同.预测的结果总是有一些不同的,所以也就导致各个数据库的结果可能不是很一样.我 ...

前几天有小伙伴问关于 miRNA 的数据库,由于 miRNA 相关的数据库太多了,要是分开介绍的话估计要好久好久.幸好,有人已经把 miRNA 相关的数据库整理好了,我们只需要基于自己的目的进行查找就 ...

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