手把手教你一刻钟零代码复现近5分单基因生信文章（附详细操作教程） / 开普饭

导语 DNA甲基化是当前研究最多的表观遗传修饰,对于促进胚胎发育,基因组印记和X染色体失活等重要生物过程至关重要.在甲基化研究的技术手段中,HM450K芯片在癌症甲基化组数据集中占主导地位.TCGA数 ...

本文的临床数据的生存分析,并没有使用TCGA数据库里面的病人信息,而是自己收集病人样本,记录其临床信息,随访时间等等.还采用IHC等病理技术手段来量化感兴趣的基因的表达量情况,最后全部使用自己的数据做 ...

大家好,我是浮浮~ 之前有小伙伴反馈说基因家族太难,还是单基因好做一些. 但是单基因的生信文章不太容易发了. 那么今天我们零代码复现一篇今年发表在Frontiers in Oncology杂志上的单基 ...

一.列线图介绍列线图也称为诺莫图,英文Nomogram,本质上是一种用于求解方程的图形计算装置.使用者可以忽略方程式中各变量的复杂关系,单根据已知的变量值去画线就可以快速解出剩下的那个未知变量的大小. ...

生信已经成为科研圈发SCI的神器了,检索PubMed上可见发表的文章不管高分低分都涉及生信,但是许多人听见生信编程就望而却步,产生恐惧心理,我们特邀请医科堂生信挖掘一对一辅导训练营周老师开设专栏,通过 ...

分分钟搞定6分单基因联合免疫浸润的预后套路生信文章小伙伴们大家好,我是菠小萝.今天为大家复现一篇2020年10月发表在<Front Oncol>(影响因子:4.848)上的单基因联合免 ...

TCGA数据库是一个包括33种癌的各个组学的数据库.我们通过TCGA数据库可以观察每个人的基因表达的变化:甲基化的变化:拷贝数的变化:以及他们的临床信息.MEXPRESS(https://mexpre ...

研究背景: 核糖核苷二磷酸还原酶亚基M2(RRM2)是核糖核苷酸还原酶的催化亚基,可调节酶活性,这对于DNA复制和修复至关重要.然而,RRM2在肺腺癌(LUAD)中的作用仍不清楚. 研究方法: 在这项 ...

看你们都无心看文献,那就给你们看看神奇工具吧 ,今天给你们讲的这个--就是--微型电视机-- 卖身契许冠杰 - 钜片名曲选呃,实际上就是一个miRNA的小工具, 其实还蛮有意思的-- 首先随便输入 ...

自从meta分析贬值了之后,生信数据挖掘成为了国内医生.研究生.博士.教师火爆的发文神器,可是令人头痛的事情来了,生信往往需要学习编程,其中R就必不可少,如果要挖TCGA.SEER,Perl或者Pyt ...

第一步,下载GEO数据库的环状RNA和miRNA.mRNA数据第二步,分别对环状RNA和miRNA.mRNA数据做差异分析(多个数据集取交集) 第三步,挑选出重要的环状RNA预测下游的miRNA,预 ...

手把手教你一刻钟零代码复现近5分单基因生信文章（附详细操作教程）