MethSurv：TCGA甲基化分析工具

相关推荐

• 5分+甲基化泛癌纯生信，值得学习

  大家好,今天要和大家分享的是2021年6月发表的一篇文章:"Pan-cancer methylation analysis reveals aninverse correlation of ...

• TCGA数据库的各个癌症甲基化芯片数据重新分析

  我这里先列出学徒作业,大家需求下载头颈癌里面的口腔癌的甲基化芯片信号值矩阵,然后挑选有N-T配对的32个病人的数据进行差异分析,就走我们介绍的champ流程即可! 理论上你掌握了这个分析策略,换成任何 ...

• 仅用公开数据集发4+分纯生信数据挖掘

  Computational Detection of Breast Cancer Invasiveness with DNA Methylation Biomarkers用DNA甲基化生物标志计算检测 ...

• 5+乳腺癌表观遗传深度剖析

  Methylome and transcriptome analyses reveal insights into the epigenetic basis for the good survival ...

• 从TCGA下载的甲基化数据格式解读

  谢京合关注 0.5022020.10.28 17:56:10字数 844阅读 600 我的天,第一次接触甲基化数据,真是令人头大. 那就先从TCGA上下载某一种癌症的甲基化数据开始吧. 1.下载. 数 ...

• 1个月接收并见刊的6分+泛癌纯生信

  "Pan-Cancer Analysis of HumanKinome Gene Expression and Promoter DNA Methylation Identifies Dar ...

• 为何要劳民伤财做同样的数据

  文章<BRCA1 Promoter Methylation Status in 1031 Primary Breast Cancers Predicts Favorable Outcomes F ...

• 根据甲基化探针信号值把样本分成CIMP组

  看到文章 PLoS Genet. 2016 ,提到了 CpG island methylator phenotype (CIMP) subtype 分组的细节 Methylation datasets ...

• 3种方法注释你的甲基化探针

  关于表达芯片的公共数据库挖掘我这边以及差不多把改写的推文在2年前就写完了,但表达芯片毕竟只占芯片市场的半壁江山,还有大量的非表达芯片,比如大名鼎鼎的甲基化芯片.关于甲基化,我们公众号教程非常少,主要是 ...

• 文献解读丨甲基化生信分析新思路发5分文章

  专注生物分析最前沿 定期解读生信文章 提供生信分析思路和套路 方便大家短平快发SCI 关于甲基化方面的探索,传统的方法无非是现在公共数据库中下载数据,差异分析构建模型,外部数据验证或者与靶基因相关性分 ...