5+乳腺癌表观遗传深度剖析 / 开普饭

导语 DNA甲基化是当前研究最多的表观遗传修饰,对于促进胚胎发育,基因组印记和X染色体失活等重要生物过程至关重要.在甲基化研究的技术手段中,HM450K芯片在癌症甲基化组数据集中占主导地位.TCGA数 ...

专注生物分析最前沿定期解读生信文章提供生信分析思路和套路方便大家短平快发SCI 关于甲基化方面的探索,传统的方法无非是现在公共数据库中下载数据,差异分析构建模型,外部数据验证或者与靶基因相关性分 ...

我这里先列出学徒作业,大家需求下载头颈癌里面的口腔癌的甲基化芯片信号值矩阵,然后挑选有N-T配对的32个病人的数据进行差异分析,就走我们介绍的champ流程即可! 理论上你掌握了这个分析策略,换成任何 ...

发表于2017年,杂志是 JOURNAL OF CLINICAL ONCOLOGY 影响因子26.303 , 文章是 CpG Methylation Signature Predicts Recurr ...

表观遗传学的概念基于遗传学而来,不是单纯的体外在环境导致的甲基化和乙酰基化改变,也不是简单转录因子和miRNA等等基因调控,它的指的是由非DNA变异而改变表型的'可遗传的'现象.现在众多所谓的表观遗传 ...

大家好,今天要和大家分享的是2021年6月发表的一篇文章:"Pan-cancer methylation analysis reveals aninverse correlation of ...

看到文章 PLoS Genet. 2016 ,提到了 CpG island methylator phenotype (CIMP) subtype 分组的细节 Methylation datasets ...

文章<BRCA1 Promoter Methylation Status in 1031 Primary Breast Cancers Predicts Favorable Outcomes F ...

大家好,这里是专注表观组学十余年,领跑多组学科研服务的易基因. 错过RRBS技术在人和小鼠疾病表观遗传特征研究的可点:Mol Biol Evol | 利用RRBS技术多维度分析人和小鼠的疾病表观遗传特 ...

谢京合关注 0.5022020.10.28 17:56:10字数 844阅读 600 我的天,第一次接触甲基化数据,真是令人头大. 那就先从TCGA上下载某一种癌症的甲基化数据开始吧. 1.下载. 数 ...

关于表达芯片的公共数据库挖掘我这边以及差不多把改写的推文在2年前就写完了,但表达芯片毕竟只占芯片市场的半壁江山,还有大量的非表达芯片,比如大名鼎鼎的甲基化芯片.关于甲基化,我们公众号教程非常少,主要是 ...

Molecular, clinicopathological, and immune correlates of LAG3 promoter DNA methylation in melanoma 黑 ...

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