footprintDB：查转录因子、靶基因，我都OK / 开普饭

一.DNA的甲基化 DNA甲基化 ① 1. 在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase, DNMTs)的作用下,将一个甲基添加的胞嘧啶的5'-碳分子>上,形成5-甲基化胞嘧( ...

一文学会footprintDB数据库使用方法嗨,小伙伴们大家好!这里是每周一弘毅专栏,我志向用小小文字助力你的SCI发表之路.本周继续转录因子话题,给大家带来转录因子综合数据库footprintDB ...

本期直播主题: 如何半小时搞定一篇医学文献? 点击预约按钮,领开播好礼! 解螺旋公众号·陪伴你科研的第2693天翻牌啦! 我们之前在介绍肿瘤表观遗传相关数据库MR4Cancer(http://cis ...

五一劳动节,连续五天,在钉钉群直播互动授课带领大家系统性掌握cytoscape软件的使用方法和技巧,课程已经结束啦.文末有录播回放学习方式,以及配套授课资料! 下面是cytoscape讲师的笔记一. ...

写在前面今天我又更新了 TBtools.不过整体上是一些小的优化.并不值得长篇大论.当然,这主要是我"水"的能力还不够.正好出门在外,不想干活,那就看一下一些 paper.忽然想 ...

做完转录组分析完之后,一般会找到一些差异表达的基因.差异表达基因中如果有转录因子的话,可以研究一下转录因子调控哪些基因的表达.要预测转录因子调控的靶基因,需要两个步骤: 1. 首先需要知道转录因子的结 ...

一般来说,我们进行数据库注释,基因数量在20到500之间,其实100个左右是比较理想的!比如使用Y叔的clusterProfiler进行gsea分析,就有 minGSSize = 10, 和 ...

我们以前写过如何寻找基因的启动子和预测转录因子:(工具篇):如何查找基因的启动子及预测转录因子?,今天我们反过来做一个事情:根据转录因子来预测靶基因. 其实我们知道很多转录因子的结合序列是相对保守的, ...

20年代上海滩颜料商大亨耗巨资建造的城堡花园住宅,巴洛克式建筑风格,位于上海最大石库门建筑群大中里,花数年时间,耗费精力用力修缮,整栋建筑原地平移57米,揭幕展首次限时开放,百年老宅第二次生命被开启. ...

编译:伊一,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读表面褐变是鲜切苹果货架期的主要限制因素,硫化氢(H2S)处理能有效抑制褐变.然而,鲜切苹果对H2S反应的分子机制却知之甚少.Micro ...

编译:Jerry,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读樟树具有较高的经济.工业价值.樟树叶片挥发油中的萜类是美容.医药产品的重要原料.然而,樟树中miRNA对萜类生物合成的调控作用尚 ...

现如今互联网的出现给大家的生活带来了前所未有的便利,淘宝.外卖.微信.支付宝等,使我们的生活变得丰富多彩,除以上这些我们还习惯用百度.搜狗等软件搜索我们想要获取的知识,在给我们提供便利的同时,也带来了 ...

在前几天的介绍当中,我们通过一篇综述了解到了tRNA的功能.其中在那篇综述当中提到了四个和tRNA有关的数据库.但是综述当中介绍的数据库基本上都是用于查询tRFs的基本信息或者查看tRFs在肿瘤当中的 ...

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