文献解读 | 15+高分文章教你如何只用公共数据库研究RNA修饰

相关推荐

• 热乎的5.5分SCI，来看看最新的预后模型文章是怎么做的

  在本项研究中,作者下载TCGA结直肠癌(CRC)数据作为训练集,GEO数据库(GSE40967,GSE12945,GSE17536,GSE17537)作为验证集.从分子特征数据库中选择上皮间质转化相关 ...

• 免疫signature傻傻分不清？一起分析就好了

  之前我们推过免疫细胞signature,也推过免疫基因signature相关的文章,但是你见过整合分析的文章吗?今天就领着大家来看看是如何分析的,文章10月发表于OncoImmunology杂志(IF ...

• 简单易学5分+单细胞挖掘套路！

  Integrated analysis of single‑cell RNA‑seq and bulk RNA‑seq unravels tumour heterogeneity plus M2‑li ...

• seurat标准流程实例之2个10x样本的项目（GSE135927数据集）

  学徒和学员已经陆续出师,是时候把生信技能树的舞台交给后辈了! 下面是<上海中医药大学研究生>的分享 前面jimmy老师分享了两个祖传的单细胞转录组数据分析代码,非常给力,是标准流程: 祖传 ...

• 如果RNA的预后分数被做过了！你可以试试这样

  DNA methylation-based prognostic biomarkers of acute myeloid leukemia patients基于DNA甲基化的急性髓细胞白血病患者的预后 ...

• 转录组讲师带你读文献-使用siRNA干扰LINC00152前后看结直肠癌表达量差异

  我在我在04-转录组笔记推文任务列表(半年期)里面安排了6个经典综述和10篇转录组应用文献给大家,可惜愿意沉下心了认真苦学的并不多.(https://share.mubu.com/doc/14uneH ...

• 纯生信10分 ，m6A甲基化修饰与肿瘤微环境

  m 6 A regulator-mediated methylation modification patterns and tumor microenvironment infiltration c ...

• 5.2分 58天接收的单基因生信，你也值得拥有

  在这篇文献中作者利用TCGA COAD数据(n=451)和GSE146771和GSE132465的数据集,以及临床收集结肠腺癌(YJSHCCOAD)患者数据(n=108),对CXCL11的预后值和基础 ...

• NEJM和JAMA连续发文，消化道肿瘤治疗谁忧谁喜？| 热心肠日报

  今天是第1784期日报. NEJM:纳武单抗显著降低食管癌或胃食管交界处癌的术后复发风险 New England Journal of Medicine[IF:74.699] ① 794名接受新辅助放 ...

• 如何筛选单基因进行诊断发3+分

  Potential Prognostic and Diagnostic Values of CDC6, CDC45, ORC6 and SNHG7 in Colorectal CancerCDC6.C ...

• RNA修饰层面

  在基因组层面--如突变,CNV等 在转录组层面--如RNA修饰 在转录后层面--如APA和A-to-I editing的功能 转录后调控(post-transcriptional control)是指 ...

• 精彩远不止m6A！这篇没有湿实验的27分 文章提出了近乎完美的模型

  一.背景介绍 RNA的修饰广泛存在于腺嘌呤A.尿嘧啶U.胞嘧啶C.鸟嘌呤G四种核糖核苷酸上,有超过170种,A是 RNA 上被修饰最多的碱基,其中有四种最常见的修饰: ①RNA的m6A修饰:  RNA ...

• Nat Commun：乳腺癌单细胞测序深度解析

  Single-cell RNA-seq enables comprehensive tumour and immune cell profiling in primary breast cancer利 ...

• 现在单细胞还想“水”CNS恐怕得多组学了

  我们组建了一大波生物信息学各项技能学习交流群,目录是: 免费视频课程<RNA-seq数据分析> 免费视频课程<WES数据分析> 免费视频课程<ChIP-seq数据分析&g ...