基于扩增子数据的宏观生态学研究 / 开普饭

写在前面无论是人体,动物还是环境,微生物组的研究都正在如火如荼.在短短的几年,已经在技术和方法等方面不断翻页.相当多的新东西不断出现,让我们作为新手进入这个领域困难重重. 不得不说,几乎所有的研究, ...

编译:橙,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读获悉微生物之间的相互作用的一般规律是推进微生物生态学进一步发展的核心内容之一.最近的研究表明,微生物之间相互作用的范围.互作强度和群落 ...

编译:橙,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读随着代谢组学技术的发展,尤其是以人类肠道中的微生物群落代谢组学为代表,为人们了解疾病患者体内被破坏的功能和稳态,分析不同调节途径之间的 ...

目前细菌群落研究常用的技术是16S相对定量扩增子测序,而最近越来越多的研究者开始采用绝对丰度(即菌群的实际数量)对细菌群落进行绝对定量研究,今天小编就微生物绝对定量研究的一些常见问题在此总结一下. 问 ...

写下前面: 现在已经是19年了,年底也快到了,各地的会议也在朋友圈此起彼伏.想想我做生物信息也三年了.故事总在发展着,去年我总结了我的生信之路,写了我是如何开始做生信的.今天我将为大家带来新的一年来的 ...

编译:环境微生物学Rivc,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读土壤蕴藏着世界生物多样性的很大一部分,为许多重要的生态系统功能做出了贡献.因此,必须确定与土壤生物的分布和功能有关的 ...

编译:YQ,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读全球微生物信息的积累促进了微生物特性和功能在宏观尺度上的量化,这些微生物的生物地理模式需要宏观生态学方法来研究其潜在机制.微生物宏观 ...

翻译:周之超@UW-Madison 生物地球化学进入病毒时代:采用多样的方法研究病毒和生物地球化学循环 Biogeochemistry Goes Viral: towards a Multifacet ...

编译:艾奥里亚,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读传统上,对种内变异的研究仅限于可培养的细菌分离株和低分辨率微生物群落指纹图谱.宏基因组测序和技术的进步使得在高通量和复杂环境中能 ...

编译:沐秋,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在植物表面和内部组织定殖的微生物为宿主提供了许多生命支持功能.尽管人们越来越认识到植物微生物群落的显著作用,但对分类学角度上高度多样 ...

需要本文原文可以联系江舜尧,文末有联系方式. 原文题目:Are multi-omics enough? 期刊:Nature Microbiology IF:N/A 发表时间:2016年7月26日通讯 ...

编译:橙,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读近几十年来,微生物生物膜的重要性逐渐受到重视,当前的研究不仅仅局限于单一物种或双物种生物膜,正朝着研究多物种生物膜群落研究方向发展,对 ...

编译:小白同学,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读分子生物学技术的发展推动了植物微生物组的研究,使一个多世纪前提出的观点能够得到检验,并产生许多新的假设.通过研究不同微生物类群和 ...

基于扩增子数据的宏观生态学研究