二代测序数据拼接之原理篇 / 开普饭

[toc] 写在前面非常感谢韦老师和凌恩公司举办的多次微生物领域的讲座,虽然之前的一段时间我没足够的时间听直播,幸好有回放,因为这里面的东西实在都是我们都在思考和目前的一些热点.这次第五期我周末抽了 ...

背景: 1.为什么要从头测序组装基因组? 基因组是不同表型的遗传基础:获得参考基因组是深入研究一个生物体全基因组的第一步也是必须的一步:从头测序组装能够对新的测序物种构建参考基因组: 2.为什么要研究 ...

image.png 一代测序:Sanger测序原理简单概述双脱氧终止反应法,聚合酶延伸链 (由于ddNTP的2'和3'都不含羟基,其在DNA的合成过程中不能形成磷酸二酯键,因此可以用来中断DNA合 ...

虽然三代测序现在已经商用,但是目前的主流还是二代测序,尤其是Illumina公司的测序方式更是大行其道.那么,下面我们从四个方面来说说illumina家的二代测序是怎么得到的生物数据. 0. 基本原理 ...

现今的生信领域几乎就是和无数的序列打交道,而这些序列的来源就是如今风靡的高通量测序技术,现今的测序不论是测RNA.DNA.miRNA还是ChIP-Seq等等,都是基于NGS(二代测序,next-gen ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读本系列的上一篇推文,即"开篇"中已经描述了宏基因组研究的基本思路和方法.先回顾一下,首先是收集样 ...

更多技术干货第一时间送达感谢简书ID:亚内士多德授权分享 EEG脑电数据预处理-原理篇本文不涉及具体的操作步骤,而是对脑电数据预处理中的每一步进行解说,根据我自己的经验来解释为什么要这么做,希望 ...

你还认为普通转录组测序没有用吗? 最近看到群里有小伙伴在讨论一个数据集 GSE140275 ,我发现它这个简单转录组测序数据发两篇sci,是关于 acute ischemic stroke 这个疾 ...

在GEO公共数据检索的时候,发现有一个数据集想要分析,但是发现是二代测序的数据,没有相关的原始数据处理经验,要怎么办呢? 二代测序对于没有生信基础的人的难点之前我们在介绍GEO分析基础的时候,提到过 ...

写在前面: 本次更新主要介绍上次未完成的Thermo Fisher和华大平台的测序原理. 2.测序流程&原理( Thermo Fisher 平台): 1)油包水PCR(Emulsion PCR ...

写在前面: 本次更新主要介绍不同平台的测序仪和一些测序的原理等. 1.不同平台测序仪器和其相关参数: 1)Illumina平台[1] 2) Thermo Fisher 平台[2] 3)华大平台[3] ...

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