技术贴 | 微生太宏基因组报告解读 | 第一篇：测序数据过滤 / 开普饭

二代测序基础知识二代测序基础概念 (这个是与二代测序相关每个部门都要掌握的) FQ数据格式高通量测序(如Illumina HiSeqTM/MiseqTM)得到的原始图像数据文件经CASAVA碱基识 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 EggNOG数据库收集了COG(Clusters of Orthologous Groups of proteins ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读为了研究样品物种组成及多样性信息,我们用Kraken2对所有样品的全部的有效序列进行注释分类.Kraken2是基于K ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读细菌抗生素耐药性是在人类为控制细菌生长而进行的大规模抗生素的使用的前提下, 细菌通过基因突变或者从环境有机体的基因水 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 ENZYME收录了7大类酶的四级分类信息.EC编号或EC号是酶学委员会(Enzyme Commission)为酶所制 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 MetaCyc数据库是一个通过实验手段阐释代谢通路的数据库.MetaCyc目标是收集所有已知生命的代谢通路.Meta ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 GO(gene ontology)数据库是基因本体联合会(Gene Onotology Consortium)所建立 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 KEGG 数据库由Kanehisa Laboratories于1995年推出,现在已经发展成为一个综合性数据库.KE ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读环境样品中的微生物物种种类多,培养难度大,而且很多是功能未知的微生物,因此与一般的动植物组学相比,微生物组学研究难度 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读本篇内容分为以下三块:(1)NMDS和PCoA分析:上一篇的多样性分析中介绍了利用QIIME2进行PCoA分析研究菌 ...

技术贴 | 微生太宏基因组报告解读 | 第一篇：测序数据过滤