周集中团队Nature子刊中网络图布局的R语言可视化复现 / 开普饭

前两天我向大家推了16s做差异分析的两个包(没有看的请点击下面链接): 1.16s分析之差异分析(DESeq2) 2.16s分析之差异OTU 挑选(edgeR) 差异做出来了如何展示,也是一个值得思考 ...

ggplot版本的网络图终于可以替代igraph了这是google上的一个尝试尝试:基于ggplot出图储存于list后批量拼图基于微生物大量的OTU,我尝试了18中layout 到这里我们就可 ...

只有一个原始数据:文末获得: 理由1:--一条函数载入微生物组分析的全部文件如何提取phyloseq中的信息理由2:一条代码过滤掉序列数少的样本理由3:一条代码:根据分组文件的分组或者ID列,或 ...

一. 频率分布图 1.1 数据准备需要将数据和代码放入同一文件夹: ATPAN.csv文件 RTPAN.csv文件 1.2 数据格式 1.3 画图 ##画左边一列2个图 dev.new() par( ...

写在前面和弦图展示微生物组丰度等信息比较好看,我带大家来画一画. 实战 otupath = "./" barpath = paste(otupath,"/circle_ ...

Cytoscape软件全套课程链接大家好!我是五角星,欢迎来到科研绘图小课堂. 上回说到(超链接)Cytoscape一款开放原代码的网络图绘制与分析软件,功能强大并且对使用者的生信基础没有要求,对于 ...

编辑推荐:为了解决超长有机磷光的寿命可调问题,作者通过将非室温磷光发射体掺杂到各种固体基质中,在不改变余辉颜色的情况下实现了宽范围的寿命调节. 超长有机磷光的合理寿命调整策略非常重要,但鲜有报道.在此 ...

通讯作者:Francesco Ciucci 通讯单位:香港科技大学单原子催化剂已被广泛研究用于几种电催化反应.但是用于电化学醇氧化较少. 在此,香港科技大学Francesco Ciucci教授团队使 ...

韦丽雪发自副驾寺智能车参考报道 | 公众号 AI4Auto 电动车最贵的部件变得越来越便宜. 没错,就是电池. 中科大一项最新研究突破了固态电池的成本瓶颈. 他们合成了一种新型固态电解质,成本 ...

气候变暖增强了微生物网络的复杂性与稳定性 Climate warming enhances microbial network complexity and stability Nature Clim ...

某些类型的心脏疾病可能很难发现,例如无症状的低射血分数,特别是在治疗最有效的早期阶段.心电图AI引导下的低射血分数筛查(EAGLE)试验旨在确定利用心电图数据开发的人工智能(AI)筛查工具是否能改善常 ...

编译:Tigobin,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 确定实体肿瘤的复杂成分是了解肿瘤发生.发展和转移的基础.虽然患者来源的样本提供了有价值的观点,但它们在多个分子水平上存在异质性,而 ...

编译:冬日暖阳,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 美国加州大学圣地亚哥分校张鹍教授等人于2019年10月14日在Nature子刊Nature Biotechnology在线发表题为< ...

编译:大师球,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 南方科技大学生命与健康科学学院生物系陈炜教授团队于2019年11月1日,在Nature Communications(IF=11.878) ...

编译:阿温,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读严重急性呼吸综合征2型冠状病毒(SARS-CoV-2)的爆发给世界各地的公共卫生系统带来了压力,大规模的人口检测是控制这种大流行 ...

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