16s分析之差异展示（热图） / 开普饭

导读: pheatmap默认会对输入矩阵数据的行和列同时进行聚类,但是也可以通过布尔型参数cluster_rows和cluster_cols设置是否对行或列进行聚类,具体看分析需求.利用display ...

热图(heatmap)用不同的颜色和颜色的深浅来直观的展示数据之间的差异.在测序类的文章里,几乎必有一幅热图用来展示差异表达基因.很多工具都可以完成热图的制作,今天这篇文章主要介绍利用R语言的 phe ...

咱公众号也不能只做一个系列,所以经过深思熟虑,打算将来慢慢增加一些内容,主要有以下几个系列TCGA数据分析系列GEO数据分析系列"老板给一个基因,我该怎么办"系列文献阅读系列R语言 ...

关于如何提问,如何高效沟通,其实我们讲解了非常多了,比如我一直推崇的邮件交流:如果你希望我回答你的问题 ,然后也会随机抽取粉丝提问进行解答:答读者问第一弹:R里面差异分析的limma包用法细节 .也高 ...

[Pheatmap 绘制多分组热图] 热图作为实验数据分布情况的直观展示方法,已经成为高分文章的不错选择,它不仅可以对数据质量进行具像化展示,还可以对数据和样品进行聚类.在R中有多个包均可绘制热图,今 ...

16s分析到多样性后我们就开始对差异OTU 进行挑选基于原始count数目,我们参考两个包来做差异分析: library(DESeq2) library(edgeR) 这里当时是首先使用edgeR包 ...

文章标题是:Tinagl1 Suppresses Triple-Negative Breast Cancer Progression and Metastasis by Simultaneously ...

难道,这不像孔雀开屏吗? 写在前面组学数据已经泛滥,但是信息的挖掘仍任重道远.顺手的工具,可以节省使用者尽可能多的时间,或者将看起来很复杂,很难以完成的事情,变得非常简单. 图形的掰弯,这个是我很久 ...

写在前面 Emmm... 学校网络或者电力应是出了问题,无法远程操作学校服务器.于是,好不容易的不碎片化的时间,还是没能用在工作上.既然如此,那么我还是要找点事情做.电视剧看了,动漫也看了,文献也刷了 ...

在组学研究中,我们常常会用到热图(Heatmap).色彩丰富的热图总能吸引读者的眼球,给文章增色.但一堆堆的色块让人眼花缭乱,背后的分析方法更让人不知从何下手.今天我们先来初步探一探门道. 热图的解读 ...

<扩增子统计绘图>系列文章介绍 <扩增子统计绘图>是之前发布的<扩增子图表解读>和<扩增子分析解读>的进阶篇,是在大家可以看懂文献图表,并能开展标准扩增 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=23891 可以使用环状图形展示基因数据比较.可以添加多种图展信息,如热图.散点图等. 本文目标: 可视化基因组数据制作环形热图环形热图很漂亮.可 ...

来源:医疗人咖啡分析原理:吸收紫外光能量,引起分子中电子能级的跃迁谱图的表示方法:相对吸收光能量随吸收光波长的变化提供的信息:吸收峰的位置.强度和形状,提供分子中不同电子结构的信息分析原理:被 ...

诸葛君说:产品/运营们最痛苦的莫过于说服开发部门同意我们的网页改版方案,他们往往会充满怀疑的反问:为什么要这样做?总之,在你无法证明"你是对的"情况下,所有的沟通仿佛都站不住脚,今 ...

16s分析之差异展示（热图）