R语言绘制圈图、环形热图可视化基因组实战：展示基因数据比较 / 开普饭

使用 XENA下载的TCGA-LAML.mutect2_snv.tsv文件绘制基因词云和突变景观图. 一基因词云有小伙伴在https://mp.weixin.qq.com/s/DvX_pKPF9b ...

写在前面久前,我开放了 TBtools 掰弯热图的功能.我自认为是TBtools的掰弯热图,至少目前还是市面上独此一家,同时,保证了所有人都上手就会用.这一功能,也已经被在一些期刊论文所引用. 无论 ...

ComplexHeatmap可以绘制很复杂的热图,能满足日常以及文章所需,本次先简单的介绍单个热图绘制的内容. 单个热图由热图主体和热图组件组成.其中主体可分为行和列:组件可以是标题.树状图.矩阵名称 ...

R语言聚类分析最佳实践 Practical Guide to Cluster Analysis in R 简介尽管有几本关于无监督机器学习的好书,但我们认为其中许多书太过理论化.本书为聚类分析,优雅 ...

我们这次直接拿GSE118390上已经normalized 的数据进行下游分析.首先我们先看看文献的这张复杂热图,哈哈,这张热图画得真是好看.左边是不同的markers基因对应的细胞类型,上边是6个T ...

交互效应分析在SCI中是一个重要的组成,可以表示特殊的人群(也就是亚组)中自变量和因变量的结果关系,可以说是高分SCI必做的项目,在SCI中,这一部分结果很多都是以森林图来展示,这样结果又直观有方便分 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 pheatmap默认会对输入矩阵数据的行和列同时进行聚类,但是也可以通过布尔型参数cluster_rows和clus ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=22492 我们将使用葡萄酒数据集进行主成分分析. 数据数据包含177个样本和13个变量的数据框:vintages包含类标签.这些数据是对生长在意大 ...

原始数据为1. HM_39mappingfile.csv,即分组信息 2. adiv_all_sorted.txt,作图所需的值.如图所示: 程序如下: library("ggplot2&q ...

白介素2的读书笔记,分享临床科研干货,一起见证时间的力量 [科研绘图点我][付费精品合集][SEER点我] image.png 数据准备 #set your work directory data&l ...

原文链接: http://tecdat.cn/?p=23697 我们使用R库mgcv,用广义加性模型(GAMs)对环境数据进行建模.mgcv是一个伟大的库,具有丰富的功能,但我们经常发现,默认的诊断 ...

简介:R语言统计与绘图公众号目前致力于分享医学统计与R绘图知识,手把手教你使用R语言绘制基线特征表.KM生存曲线.森林图.ROC曲线等.每天一篇精彩R语言推文教程,手把手带你入门R语言绘图. 今天推文 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=22984 一旦我们清理了我们的文本并进行了一些基本的词频分析,下一步就是了解文本中的观点或情感.这被认为是情感分析,本教程将引导你通过一个简单的方法 ...

R语言绘制圈图、环形热图可视化基因组实战：展示基因数据比较