TCGA|根据somatic mutation绘制突变景观图（oncoplot）和基因词云 / 开普饭

海普周报精准医疗时代需要高质量繁荣第 30 期 >>>DNA损伤修复(DDR)通路: 免疫治疗预测的潜在Biomarker<<< 每周新知 ▲上期回顾(点击图片 ...

我们在前面的教程:不是maf格式的somatic突变数据就没办法读入到maftools了么,提到了假如小伙伴们是在在 https://xenabrowser.net/datapages/ ,找到 G ...

jimmy 生信技能树联盟创始人有这个想法很久了,我教了很多人如何批量下载TCGA数据,以及分析各个癌症的somatic突变信息以及TMB,还有突变的特征频谱. 下载TCGA所有癌症的maf文件计算 ...

发表于2016年的NC,The somatic mutation profiles of 2,433 breast cancers refine their genomic and transcrip ...

转自:程凉皮儿:https://www.jianshu.com/p/7b02459defedmaftools_2clp02 June, 2020maftools : 总结.分析.可视化 MAF文件ma ...

臻和科技携手复旦大学附属华山医院-陈志明主任发表研究于"Aging(Albany NY)"(IF:4.831):本研究采用臻和百适博产品进行检测. 本期导读大量研究表明,免疫治疗 ...

疫情期间发布了<肿瘤基因测序数据分析>课程,: 官方链接是:https://www.bilibili.com/video/BV1Sy4y1S7pz/ 课程思维导图:https://mubu ...

一名18个月大的女孩从出生后第3天,开始出现反复发作的脑病,并延迟发育.她的父母是非血缘性的.她患有小头畸形,全身性肌张力减退,快速伸展反射,伸肌腱反应,舞蹈运动和手脚肌张力障碍.评估显示代谢性酸中毒 ...

为了分析不同类型.组织起源肿瘤的共性.差异以及新课题.TCGA于2012年10月26日-27日在圣克鲁兹,加州举行的会议中发起了泛癌计划.参考:https://www.ncbi.nlm.nih.gov ...

*仅供医学专业人士阅读参考 2021年2月11-13日,正值我国新春佳节之际,美国临床肿瘤学会泌尿生殖系统肿瘤研讨会(ASCO-GU)以云端形式召开,全球各地泌尿肿瘤领域专家大咖通过线上虚拟会议的方式 ...

刚才听了一个讲座,题目很吸引人,关于癌症研究和进化生物学的主题,主讲人是吳仲義教授,澳大濠江傑出訪問學者.芝加哥大學教授.2004年當選中央研究院院士及美國科學促進協會外籍會員.曾擔任芝加哥大學生態與 ...

这两天"王院长"帮别人分析snv数据,顺便给我推荐了一个R包:maftools.我看了一下官网,感觉是个非常强大的R包.那必须要学习起来~实际上网上已经有很多教程了,但都是用maf ...

TCGA|根据somatic mutation绘制突变景观图（oncoplot）和基因词云