指定病人的指定基因的突变全景瀑布图 / 开普饭

转自:程凉皮儿:https://www.jianshu.com/p/7b02459defedmaftools_2clp02 June, 2020maftools : 总结.分析.可视化 MAF文件ma ...

使用 XENA下载的TCGA-LAML.mutect2_snv.tsv文件绘制基因词云和突变景观图. 一基因词云有小伙伴在https://mp.weixin.qq.com/s/DvX_pKPF9b ...

众所周知,癌症具有异质性,在乳腺癌领域,不同亚型的癌症比不同器官来源癌症的差异要大很多.最简单癌症分类,当然是一个基因,比如ER阳性或者ER阴性的乳腺癌患者,并不是说人类有2万多个蛋白编码基因就可以有 ...

这两天"王院长"帮别人分析snv数据,顺便给我推荐了一个R包:maftools.我看了一下官网,感觉是个非常强大的R包.那必须要学习起来~实际上网上已经有很多教程了,但都是用maf ...

基因定点突变:为了研究某一基因的功能,我们通常不仅需要研究其野生型基因的功能,也需要进一步去挖掘它发挥作用时是哪一个结构域,甚至是哪一个氨基酸发挥了作用.而这里面就涉及到了如何设计定点突变引物的问题, ...

全基因组分析后的vcf突变文件记录了四百多万个位点,前面我们讲到了如何把它们注释到dbSNP数据库ID,一般来说有注释的位点也就顺便注释到了基因,所以可以简单写一个程序来看看哪些基因的突变位点最多: ...

发表于2016年的NC,The somatic mutation profiles of 2,433 breast cancers refine their genomic and transcrip ...

该基因最早发现于间变性大细胞淋巴瘤,因此得名ALK(anaplastic lymphoma kinase,间变性大细胞淋巴瘤激酶).后来在多个癌症中发现,是强力的致癌驱动基因. ALK蛋白位于细胞膜上 ...

C#中,Timer是一个定时器,它可以按照指定的时间间隔或者指定的时间执行一个事件. 指定时间间隔是指按特定的时间间隔,如每1分钟.每10分钟.每1个小时等执行指定事件: 指定时间是指每小时的第30分 ...

1. 目标:批量移动E:/BaiduNetdiskDownload/jaffedbase/resize128_out目录下的所有文件夹里的图片,移动到指定E:/BaiduNetdiskDownloa ...

基因定点突变即按照设计要求,使基因的特定序列发生插入.删除.置换和重排等变异.利用PCR等方法向目的DNA引入突变.定点突变能迅速.高效低提高DNA所表达的目的蛋白的形状及表征,使基因研究工作中的有效 ...

肺癌丨精准医疗,针对EGFR敏感突变的靶向治疗肺癌丨精准医疗,EGFR靶点类型解析-18外显子肺癌丨精准医疗,EGFR靶点类型解析-19外显子肺癌丨精准医疗,EGFR靶点类型解析-20外显子肺 ...

指定病人的指定基因的突变全景瀑布图