技术贴 | R语言：手把手教你画pheatmap热图 / 开普饭

pheatmap是一个非常受欢迎的绘制热图的R包.ComplexHeatmap包即是受之启发而来.你可以发现Heatmap()函数中很多参数都与pheatmap()相同.在pheatmap的时代(请允 ...

在前期我们为大家介绍了[R包荟萃]热图绘制工具:pheatmap包详解,其中想要绘制分组的热图时需要两个数据,即原始表达矩阵mat和分组信息annotation_col,其中annotation_co ...

前两天我向大家推了16s做差异分析的两个包(没有看的请点击下面链接): 1.16s分析之差异分析(DESeq2) 2.16s分析之差异OTU 挑选(edgeR) 差异做出来了如何展示,也是一个值得思考 ...

写在前面我有一次想用patchwork拼图,但是我查看了好多推文(见结尾参考),都无法完整完成我的全部要求.我在微信搜一搜里面输入patchwork,往下翻看了至少200篇帖子,这些帖子将patch ...

关于免疫浸润分析,可谓是最近一段时间的热点,很多文章基于肿瘤免疫细胞微环境进行分析,不管是进行下游基因筛选也好,还是构建诊断模型也好,发表了很多相关的研究.在前面关于<CIBERSORT在免疫浸 ...

本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读上期介绍了利用WGCNA包中的Cor函数和corPvalueStudent函数计算两组小样本的相关性并进行热图可 ...

[Pheatmap 绘制多分组热图] 热图作为实验数据分布情况的直观展示方法,已经成为高分文章的不错选择,它不仅可以对数据质量进行具像化展示,还可以对数据和样品进行聚类.在R中有多个包均可绘制热图,今 ...

# 6. 可视化展示 ---------------------------------------------------------------- ##6.1 火山图 library(ggplot ...

咱公众号也不能只做一个系列,所以经过深思熟虑,打算将来慢慢增加一些内容,主要有以下几个系列TCGA数据分析系列GEO数据分析系列"老板给一个基因,我该怎么办"系列文献阅读系列R语言 ...

利用R语言堆叠图,我们可以将一个项目中所有样品的物种组成展示出来.下面介绍如何利用R语言进行物种组成分析和可视化.过程分为以下几步: 1)模拟丰度矩阵: 2)模拟分组: 3)标准化丰度: 4)调整格式 ...

本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读分享一个利用R语言在画板中只画图例不画图的方法.第一步还是需要用plot一个图,但是利用一些参数可以将图清除掉,然后 ...

本文由微科盟技均根据实践经验而整理,希望对大家有帮助.微科盟原创微文,欢迎转发转载.在上篇技术贴"手把手教你如何做扩增子菌群数据与表观数据相关性热图"中,我们通过Excel进行了相 ...

春意盎然,很多人家里都会习惯的摆上一盆水仙花,不仅美观大方且气味幽香.今天特意给大家带来工笔画入门教程工笔水仙的画法,就让我们拿起笔来开始吧! 花语:敬意.纯洁.吉祥古诗摘录冰魂月魄水精神,翠袂凌 ...

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