多分组热图不用愁，Pheatmap来帮忙 / 开普饭

创作原因用法参数可视化综合示例结语创作原因目前最为常见的热图绘制R包,主要包括pheatmap和ComplexHeatmap(仅个人使用习惯).它们强大的功能,基本可以满足所有科研人员的 ...

前两天我向大家推了16s做差异分析的两个包(没有看的请点击下面链接): 1.16s分析之差异分析(DESeq2) 2.16s分析之差异OTU 挑选(edgeR) 差异做出来了如何展示,也是一个值得思考 ...

实际上写完了这个全网最好的差异分析代码:免费的数据分析付费的成品代码我就可以收工用来,但是永远不能低估粉丝的疑惑数量,任何一个细节都会被拿出来剖析. 比如代码里面我挑选了top1000的sd基因绘制 ...

关于如何提问,如何高效沟通,其实我们讲解了非常多了,比如我一直推崇的邮件交流:如果你希望我回答你的问题 ,然后也会随机抽取粉丝提问进行解答:答读者问第一弹:R里面差异分析的limma包用法细节 .也高 ...

pheatmap是一个非常受欢迎的绘制热图的R包.ComplexHeatmap包即是受之启发而来.你可以发现Heatmap()函数中很多参数都与pheatmap()相同.在pheatmap的时代(请允 ...

前面我们在教程:使用R包deconstructSigs根据已知的signature进行比例推断,顺利的把508个病人,根据11个signature进行了比例推断,得到的比例矩阵以普通的热图,以及phe ...

导读: pheatmap默认会对输入矩阵数据的行和列同时进行聚类,但是也可以通过布尔型参数cluster_rows和cluster_cols设置是否对行或列进行聚类,具体看分析需求.利用display ...

本文由可爱的乔巴根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读上期介绍了利用WGCNA包中的Cor函数和corPvalueStudent函数计算两组小样本的相关性并进行热图可 ...

咱公众号也不能只做一个系列,所以经过深思熟虑,打算将来慢慢增加一些内容,主要有以下几个系列TCGA数据分析系列GEO数据分析系列"老板给一个基因,我该怎么办"系列文献阅读系列R语言 ...

天热,就容易犯愁吃什么.和大家分享8道小凉菜做法,简单省事又爽口开胃,很适合夏天哦~ 第一道:菠菜粉丝菠菜,在焯水之后,质地变得更为鲜嫩也更易入味,与粉丝搭配在一起,一绿一白,颜色一看就很清爽诱人, ...

第一道:菠菜粉丝菠菜,在焯水之后,质地变得更为鲜嫩也更易入味,与粉丝搭配在一起,一绿一白,颜色一看就很清爽诱人,再拌一些调味料,每一口都特别开胃下饭. 具体制作方法第一步:准备食材.菠菜1小把.干 ...

将「雷科技Lite」收藏为我的小程序,不再错过精彩内容小雷公司有个运营妹纸是表情包大神,无论你发什么文字都能用表情包回答你~ 这就算了,还时不时的发表情包整蛊我. 除了这种屏幕脏了,怎么擦都擦不掉的 ...

天冷.天热,就容易犯愁吃什么.和大家分享8道小凉菜做法,简单省事又爽口开胃,很适合夏天哦~ 第一道:菠菜粉丝菠菜,在焯水之后,质地变得更为鲜嫩也更易入味,与粉丝搭配在一起,一绿一白,颜色一看就很清爽 ...

中医认为与精血亏虚.气滞血瘀有关.1.当归12克.白芍12克.川芎10克.熟地12克.白果5个.首乌9克.桑叶10克,水煎服,每日一剂.2.生地15克.白薇15克.赤芍12克.丹皮12克.地骨皮12克 ...

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本文由阿童木根据实践经验而整理,希望对大家有帮助. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 pheatmap默认会对输入矩阵数据的行和列同时进行聚类,但是也可以通过布尔型参数cluster_rows和clus ...

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