使用NMF代替层次聚类 / 开普饭

[Pheatmap 绘制多分组热图] 热图作为实验数据分布情况的直观展示方法,已经成为高分文章的不错选择,它不仅可以对数据质量进行具像化展示,还可以对数据和样品进行聚类.在R中有多个包均可绘制热图,今 ...

Heterogeneity of MSI-H gastric cancer identifies a subtype with worse survival通过MSI-H胃癌的异质性识别生存期较差的亚 ...

前两天我向大家推了16s做差异分析的两个包(没有看的请点击下面链接): 1.16s分析之差异分析(DESeq2) 2.16s分析之差异OTU 挑选(edgeR) 差异做出来了如何展示,也是一个值得思考 ...

Effect of m6A RNA Methylation Regulators on Malignant Progression and Prognosis in Renal Clear Cell ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=22838 本练习问题包括:使用R中的鸢尾花数据集 (a)部分:k-means聚类使用k-means聚类法将数据集聚成2组. 画一个图来显示聚类的 ...

层次聚类顾名思义,是按照层次来进行聚类,其中不同的层次构成了树状结构的不同层级,叶子节点则对应真实的样本点,示意如下对于这颗聚类树而言,其构建方式可以分为以下两种 1. 自下而上,由叶子节点开始,将 ...

原文链接: http://tecdat.cn/?p=20960 为了说明层次聚类技术和k-均值,我使用了了城市温度数据集,其中包括几个城市的月平均气温. 我们有15个城市,每月进行一次观测 boxpl ...

表达分析是转录组数据分析中占比很大的一部分内容,可以说是转录组文章的半壁江山了.什么层次聚类.k-mean聚类.mfuzz聚类.WGCNA,什么热图.折线图.网络图,看起来花团锦簇.今天,我们就来点评 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=5673 <第二十二条军规>是美国作家约瑟夫·海勒创作的长篇小说,该小说以第二次世界大战为背景,通过对驻扎在地中海一个名叫皮亚诺扎岛(此岛 ...

原文链接:http://tecdat.cn/?p=2981 聚类分析算法很多,比较经典的有k-means和层次聚类法. k-means聚类分析算法 k-means的k就是最终聚集的簇数,这个要你事先自 ...

Crawler/ML:爬虫技术(基于urllib.request库从网页获取图片)+HierarchicalClustering层次聚类算法,实现自动从网页获取图片然后根据图片色调自动分类网上教程太 ...

ML之HierarchicalClustering:自定义HierarchicalClustering层次聚类算法输出结果更新-- 实现代码 # -*- encoding=utf-8 -*- f ...

ML之Hierarchical clustering:利用层次聚类算法来把100张图片自动分成红绿蓝三种色调输出结果实现代码 #!/usr/bin/python # coding:utf-8 fr ...

使用NMF代替层次聚类