scRepertoire||单细胞免疫组库分析：R语言应用(二) / 开普饭

学习单细胞转录组肯定先来一遍Seurat官网的标准流程. 数据来源于Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC),共2700个单细胞, Illumina Next ...

简介Seurat是一个r包,被设计用于单细胞rna-seq数据的细胞质控和分析.Seurat旨在使用户能够识别和解释单细胞转录组数据中的异质性来源,同时提供整合不同类型的单细胞数据的函数.目前Seur ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 前情回顾 10× Genomics单细胞免疫组库V ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 我们生活着的世界并非只有我们自己,而是有很多小于或 ...

前面我带领大家通过IMGT数据库认知免疫组库,而且也一起从IMGT数据库下载免疫组库相关fasta序列,免疫组库重要的研究对象就是分成BCR的IGH,IGK,IGL这3类,以及TCR的TRA,TRB, ...

其实我不是很想写这个免疫组库专题了,阅读量太低,估计认真跟下去也不会很多. 前面我带领大家通过IMGT数据库认知免疫组库,而且也一起从IMGT数据库下载免疫组库相关fasta序列,免疫组库重要的研究对 ...

使用igblast进行免疫组库分析使用MiXCR进行免疫组库分析理论上不应该再介绍过多软件和流程,避免增加大家的认知负担,但是看到一个很新的文章发表在NC杂志,时间是11 April 2019,标 ...

男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树, 一枚大型测序工厂的螺丝钉, 一个随机森林中提灯觅食的津门旅客. 在做10X单细胞免疫组库分析的是往往是做一部分BC ...

编译:冬日暖阳,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 美国斯坦福大学医学院William J.Greenleaf等人于2019年12月2日在国际顶级刊物NatureBiotechnology ...

免疫组库测序(Immune Repertoire Sequencing,IR-Seq)是非常小众的产品,并不属于TCGA的7种数据(WGS,WES,RNA-seq,miRNA,450K等等),所以我并 ...

前面我在生信技能树的推文教程:通过IMGT数据库认知免疫组库提到了它是目前免疫组库相关fasta序列整理的最齐全的.(因为被黑粉举报,所以我们公众号时隔半个月才能继续发原创,让大家久等了) 真的是搞 ...

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