TCGA数据分析系列（二）：数据库之GEPIA2 / 开普饭

Notch信号通路在癌症中的作用分析基因在癌症中作用的文章,一般都是分析单基因或者基因家族,今天让我们一起通过2021年6月发表在Cancers (IF:6.639)上的文章"A Comp ...

关于TCGA表达数据的分析.之前我们我们介绍过.目前可能用的最多的也就是GEPIA了.之前在GEPIA2发表的时候(GEPIA I, GEPIA II),我们对这个数据库进行了介绍.最近.GEPIA的 ...

生信已经成为科研圈发SCI的神器了,检索PubMed上可见发表的文章不管高分低分都涉及生信,但是许多人听见生信编程就望而却步,产生恐惧心理,我们特邀请医科堂生信挖掘一对一辅导训练营周老师开设专栏,通过 ...

昨天介绍的TC3A是基于TCGA肿瘤数据来进行分析的,而这次的这个APA atlas (https://hanlab.uth.edu/apa/)则是基于GTEx的数据来分析的.如果不清楚TCGA和GT ...

GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)这个工具可以说是分析TCGA数据库数据分析工具中比较简单好用的工具了,包括生存分析,表达差异分析,相关性分析等, ...

有小伙伴后台留言说想知道 GEPIA 数据库的用法,正好最近一段时间GEPIA2更新了,其中也更新了一些新的功能.所以就趁着这个机会给大家介绍一下GEPIA2吧. 有小伙伴后台留言说想知道 GEPIA ...

大家好,我是老米,学习生信一个月,这是我的第二篇Markdown.不知道多少人还记得我的第一个作品:原来一个星期真的可以零基础入门TCGA数据挖掘,甚至markdown写作公众号投稿 (感兴趣的自己点 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2612天肝癌纯生信大家好,我是Jerry,今天我给大家分享一篇单基因在肝癌疾病方面的纯生信文章,该文章是发表于Aging-US杂志上,最新影响因子为5.682分.该篇 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2590天无代码生信复现大家好,我是Jerry,今天我给大家分享一篇最新的单基因泛癌生信文章,该文章是发表于Frontiers in Immunology杂志上,最新影 ...

生信论文的套路 ONCOMINE从全景.亚型两个维度做表达差异分析: 临床标本从蛋白水平确认(或HPA数据库),很重要: Kaplan-Meier Plotter从临床意义的角度阐明其重要性: cBi ...

TCGA数据分析系列（二）：数据库之GEPIA2