可能是最出名的TCGA表达相关数据库介绍(一) / 开普饭

看到了一个综述,标题是 :<ID4 controls luminal lineage commitment in normal mammary epithelium and inhibits B ...

数据库技术是研究.管理和应用数据库的一门软件科学.通过研究数据库的结构.存储.设计.管理和应用的基本理论和实现方法,对数据库中的数据进行处理和分析. 本文我们将介绍几种数据库和数据挖掘技术,帮助临床研 ...

大家好,我是老米,学习生信一个月,这是我的第二篇Markdown.不知道多少人还记得我的第一个作品:原来一个星期真的可以零基础入门TCGA数据挖掘,甚至markdown写作公众号投稿 (感兴趣的自己点 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2612天肝癌纯生信大家好,我是Jerry,今天我给大家分享一篇单基因在肝癌疾病方面的纯生信文章,该文章是发表于Aging-US杂志上,最新影响因子为5.682分.该篇 ...

生信论文的套路 ONCOMINE从全景.亚型两个维度做表达差异分析: 临床标本从蛋白水平确认(或HPA数据库),很重要: Kaplan-Meier Plotter从临床意义的角度阐明其重要性: cBi ...

要分析测序数据,一般都会想到的是TCGA (当然GEO上也有部分的测序数据).但TCGA上只有肿瘤的相关研究,我们如想要研究其他疾病,甚至研究其他物种的测序数据, 其实可以看点别的,比如上EMBL-E ...

大量的生物学研究都是基于单个基因,不管你是实验室祖传的明星基因还是自己通过文献积累凭感觉挑选到的基因,在完善自己的生物学故事的时候,都需要在开头加上一些引人入胜的证据来说明自己文章定位的基因的重要性. ...

GEPIA, 全称GeneExpression Profiling Interactive Analysis.这个数据库是2017年7月由北京大学张泽民教授团队的唐泽方等人通过 R .Perl等语言对 ...

GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)这个工具可以说是分析TCGA数据库数据分析工具中比较简单好用的工具了,包括生存分析,表达差异分析,相关性分析等, ...

最近看到某公司宣传他们的产品,是lncRNA的芯片,文章是2015发表的,研究思路很清晰: 119个食管癌病人的肿瘤组织和配对样品的lncRNA芯片数据,在GSE53624 芯片平台比较老旧了,是Ag ...

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