GEPIA，无编程生信小白福音 / 开普饭

有小伙伴后台留言说想知道 GEPIA 数据库的用法,正好最近一段时间GEPIA2更新了,其中也更新了一些新的功能.所以就趁着这个机会给大家介绍一下GEPIA2吧. 有小伙伴后台留言说想知道 GEPIA ...

研究背景: 卵巢癌在全球与妇科癌症相关的死亡中排名第五.到目前为止,尚未完全了解卵巢癌的肿瘤发生和预后的分子机制.这项研究旨在发现参与卵巢癌的hub基因和治疗药物. 研究方法: 从Gene Expre ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2236天大家好,我是风.有肿瘤研究方向的学员来问我,能不能为新人来详细分析一篇肿瘤研究的零代码生信文章,今天这篇Identification of Therapeuti ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2612天肝癌纯生信大家好,我是Jerry,今天我给大家分享一篇单基因在肝癌疾病方面的纯生信文章,该文章是发表于Aging-US杂志上,最新影响因子为5.682分.该篇 ...

数据库技术是研究.管理和应用数据库的一门软件科学.通过研究数据库的结构.存储.设计.管理和应用的基本理论和实现方法,对数据库中的数据进行处理和分析. 本文我们将介绍几种数据库和数据挖掘技术,帮助临床研 ...

TIMER是交互式web工具,能够全面.灵活地分析肿瘤浸润免疫细胞并可视化,采用反褶积方法从TCGA中不同癌症类型样本的基因表达谱中推断肿瘤浸润免疫细胞(B细胞.CD4+T细胞.CD8+T细胞. ...

之前我们介绍过一些用来预测基因在肿瘤当中表达情况的数据库.例如,GEPIA.UALCAN这些的.这些的数据库主要是通过输入目标基因,同时点击想要进行分析的模块就可以返回相关的结果.如果厌倦了点点点的话 ...

作者注:虽然是实战,其实只能称得上学习笔记而已,初学过程中参考了大量博客和帖子,还有大神引用的大牛的帖子,参考列表见最后. 1.软件安装 1.1 硬件系统情况系统:BioLinux8(ubuntu1 ...

上一期结束的时候留了个小问题: 一.前情回顾首先,数据还是要分组的,因为如果放一列就是一组,最后还得一个一个改(Ctrl+鼠左双击),很麻烦. 那数据的B/C/D列一起作图会是怎样为什么会这样,上 ...

解螺旋公众号·陪伴你科研的第2562天零代码复现基因家族分析今天我为大家带来一篇发表在Frontiers in Oncology杂志上,影响因子为4.848的一篇分析基因家族的生信文章,之前我复现 ...

之前有粉丝在后台留言说:向Frontiers in Oncology投稿的时候被该期刊主编告知:Frontiers in Oncology不再接收纯生信数据挖掘类文章(没有实验验证的).具体邮件说明如 ...

GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn/index.html)这个工具可以说是分析TCGA数据库数据分析工具中比较简单好用的工具了,包括生存分析,表达差异分析,相关性分析等, ...

下载数据切换到工作目录:cd d/生信技能树-视频直播/第七讲 kegg2gene(第六讲kegg数据解析结果) 暂时不用新的kegg注释数据为了能够统一答案差异基因list和背景基因list 关 ...

题目人类基因组外显子区域长度学员:x2yline 具体题目详情请参考生信技能树论坛题目数据来源为:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/CCDS/current_huma ...

学习感悟首先说明一下,我不算是完全从0开始学习,因为生物的知识和python的语言之前都知道一点,但说实话,我的python距离真正的实践还差的很远,也没有常用所以基本忘完. 真的很感谢群主和老师们 ...

题目:hg19基因组序列的一些探究学员:x2yline 具体题目详情请参考生信技能树论坛数据来源:http://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/bi ...

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