不同的DNA甲基化有助于茶树中的重复基因进化和冷响应 / 开普饭

谢京合关注 0.5022020.10.28 17:56:10字数 844阅读 600 我的天,第一次接触甲基化数据,真是令人头大. 那就先从TCGA上下载某一种癌症的甲基化数据开始吧. 1.下载. 数 ...

真正做生信工具(R包,软件,网页)的很少,但是需要用工具的却超级多,比如:GEPIA2详解(中国智造-肿瘤数据库),主要是看表达量和生存,引用就是(1659+130),再比如GDCRNATools这个 ...

和甲基化有关的. 可以先了解下甲基化: 450k甲基化基础 450K甲基化芯片数据处理传送门 450k甲基化芯片常用工具包:ChAMP和minfi等. 甲基化的一些预备知识甲基化程度的量化 imag ...

淀粉合成是作物灌浆的基本特征,但对其合成基因表达的分子调控机制目前仅限于转录因子(TF).在这里,我们获得了玉米胚乳在多个发育阶段的转录组.小RNA组和DNA甲基组数据,并建立了淀粉合成的调控网络图谱 ...

RNA 指导的 DNA 甲基化 (RdDM) 在 CG.CHG 和 CHH 环境中的从头甲基化中起作用. 本研究,我们通过图位克隆获得了水稻 OsNRPE1 基因,它编码 RNA 聚合酶 V (Pol ...

MethylMix: an R package for identifying DNA methylation-driven genes. 本文参考:识别甲基化驱动的癌症基因 GetData函数,怎么 ...

今天是生信星球陪你的第778天大神一句话,菜鸟跑半年.我不是大神,但我可以缩短你走弯路的半年~ 就像歌儿唱的那样,如果你不知道该往哪儿走,就留在这学点生信好不好~ 这里有豆豆和花花的学习历程,从新手 ...

DNA甲基化改变了基因组的表观遗传格局,在调节基因表达中起着关键作用,并确保转座子沉默.正如与异常DNA甲基化景观相关的许多缺陷所证明的,建立适当的组织特异性甲基化模式是至关重要的.然而,这种差异是如 ...

表观遗传调控衰老相关基因,警惕DNA甲基化引发过早衰老 (衰老理论2-甲基化老化理论) 表观遗传学通常被定义为与基因组功能相关的改变,不涉及核苷酸序列的改变,如DNA甲基化或组蛋白修饰.据报道,表观遗 ...

全基因组分析造血细胞中的DNA甲基化:WGBS的DNA甲基化分析 First Online: 23 July 2017 译者注意:文章感觉什么都没说,也就是讲一下背景,测序中的步骤,可以了解一下,中间 ...

推荐:江舜尧编译:小羊编辑:马莉法国巴黎自然科学大学居里研究所遗传与发育生物学系Greenberg MVC和 Bourc'his D两位教授于2019年8月9日在Nature Reviews | ...

易点评在精准医学系列文章中我们介绍过有关血液中甲基化标志物在大肠癌复发监测中的应用,今天则为大家带来一篇关于粪便甲基化标志物在大肠癌早期筛查中应用的综述.在这篇综述中作者调研了2020年1月之前发表 ...

易点评本研究是膀胱癌预防.检测方面医学研究的典范.作者巧妙运用了中山纪念医院(SYSMH).癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达总表(GEO)的研究数据,以及MassARRAY检测技术,确定了膀胱癌 ...

在构成人体的DNA的分子中,只有一小部分(约3%)是由基因.基本的构建基块或我们的身体组成的,其余的被认为是暗物质,因为它似乎没有什么生物学意义.在这个区域之外,最重要的是由科学家称之为转座子或转座子 ...

植物分期的小干扰RNA(phasiRNA)有助于雄性强健的生育能力. 但是,特定功能仍未定义. 在玉米(Zea mays)中,雄性不育23(ms23)是24-nt phasiRNA前体(24-PHAS ...

不同的DNA甲基化有助于茶树中的重复基因进化和冷响应