Nature子刊：微生物来源分析包SourceTracker / 开普饭

监控作为底层基础设施的一环,是保障生产环境服务稳定性不可或缺的一部分,线上问题从发现到定位再到解决,通过监控和告警手段可以有效地覆盖了「发现」和「定位」,甚至可以通过故障自愈等手段实现解决,服务开发和 ...

为进一步提高<微生物组实验手册>稿件质量,本项目新增大众评审环节.文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见.公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅 ...

写在前面: easy_microbiome上线已经一年多了,但是一直挂到github上,星星也已经超过20个了我一直也没有进行一个推送,这次进行一个推送,整体图片包含许多 https://gith ...

写在前面做扩增子数据分析经常遇到一个问题?我们是否应该抽平数据呢?还是只需要做标准化就可以了?在微生信生物群中有许多人都问过这样的问题.这里我也将这个答案分享给大家. 抽平实际上,抽平被许多数据分 ...

微生物来源分析微生物来源分析写在前面最近由于老板有分析项目,我实在是进展缓慢,一直苦恼并艰难的探索和进展,所以很长时间没有和大家见面了,今天我为大家带来的source tracker分析,使用前 ...

写在前面 Qiime2是大佬们集中已有的资源和对扩增子领域的思考而成的一个集成的,一个大杂烩的软件.但是,事实上Qiime也是一个大杂烩,不过是命令的大杂烩,将全部不同功能的命令组合到一起,超过200 ...

编译:卡Melo,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读过度使用抗生素导致多重耐药病原体和发病率增加,而微生物群可通过直接和间接两种方式产生定殖抗力(colonizationresi ...

推荐:江舜尧编译:Jione.song 编辑:小菌菌以色列希伯来大学医学院以色列-加拿大医学研究所发展生物学和癌症重点实验室Ihab Ansari等人于2020年2月3日在顶级期刊Nature M ...

推荐:江舜尧编译:Jione.song 编辑:小菌菌美国德克萨斯州达拉斯的德克萨斯大学西南医学中心微生物学系Angel G. Jimenez 等人于2019年12月23日在微生物顶级期刊Natur ...

Heterogeneity of human bone marrow and blood natural killer cells defined by single-cell transcripto ...

在大多数肿瘤类型中都发现了B细胞相关的自身免疫应答,并且通过肿瘤相关抗原(tumor-associated antigens, TAAs)的自身抗体得到了证明.自身抗体的产生可能先于疾病症状,持续数月 ...

编译:小鹿同学,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读尽管临床管理有所改善,异体造血干细胞移植(HSCT)仍然会造成高发病率和高死亡率,主要原因是移植物抗宿主病(GvHD).近年来有 ...

推荐:江舜尧编译:微土壤编辑:江舜尧福建师范大学黄志群教授团队等于2019年3月22日在Nature Communications上发表题目Meta-analysis shows positiv ...

编译:Mushroom,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读抗生素治疗会导致肠道微生物群落多样性持续降低,这会影响微生物群落的功能,抗菌素的耐药性,甚至可能影响宿主健康.然而,有关 ...

编译:国民少女,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读由于数据的复杂性,微生物组数据的差异丰度(DA)分析仍然是一个具有挑战性的问题.在本文中,我们定义了"采样分数&quo ...

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