拟南芥的差异分析结果注释 / 开普饭

利用R包DEseq2进行差异表达分析和可视化 count数矩阵差异分析 1. 安装并载入R包 2. count数矩阵导入并对矩阵进行数据处理 3. 查看样本相关性并采用热图展示 4. hclust对 ...

任务载入表达矩阵,然后设置好分组信息用DEseq2进行差异分析,也可以走走edgeR或者limma的voom流程基本任务是得到差异分析结果,进阶任务是比较多个差异分析结果的异同点. 了解差异基因 ...

编译:不二,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读背景:大部分对重度抑郁症(MDD)生物学基础的研究来源于啮齿动物慢性应激模型.虽然这些模型拥有某些MDD的行为和神经内分泌特征,但它们 ...

编译:秋刀鱼,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读氨气(NH3)是由化工厂和牧场中产生的最常见的有害气体,也是雾霾中的主要成分.然而,NH3对肠道的损伤作用仍不清楚.本研究中作者选取 ...

在文章中,植物激素通路分析常以下面两种形式的图片来展示分析结果.其一,依赖于 KEGG pathway 的通路图,在此基础上将通路中的基因用不同颜色来展示其在转录组数据中的上下调情况. 另外一种类型, ...

拟南芥是植物领域应用较为广泛的模式生物.由于具有较小的基因组(135 Mbp),生命周期短,可以在多种环境下生长,一直被视为研究植物遗传学.进化.种群遗传学和植物生长发育的系统. 农杆菌介导的蘸花法是 ...

组蛋白甲基化在许多植物的干旱反应中起着重要的调节作用,但其在茶树干旱反应中的调节机制仍知之甚少.在这里,干旱胁迫被证明可以降低茶树的相对含水量并显着下调组蛋白H3K4的甲基化. 根据我们之前对SDG基 ...

茎端器官边界边界在植物生长和形态建成中起着重要作用.据报道,一个编码富含半胱氨酸的 EPIDERMAL PATTERNING FACTOR-LIKE (EPFL)家族分泌肽的基因,EPFL2,在拟南芥 ...

Calcium currents characterize the developing pollen tube in the small mustard plant Arabidopsis and ...

纤维素是由纤维素合酶(CESA)复合物(CSC)在植物细胞的质膜上产生的. CSC被组装在内膜系统中,然后运至质膜. 因为CESA仅在质膜中起作用,所以控制CSC分泌可调节纤维素的合成. 我们确定了 ...

编译:微科盟 Nicole,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读拟南芥的昼夜节律控制着许多生理和分子过程,使植物能够预测其环境的每日变化.然而,mRNA水平变化如何与共转录/转 ...

编译:微科盟寒江雪,编辑:微科盟景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读植物对氮和硫有依赖,当它们的供应不充足时,它们经常不得不应对长期的限制条件.本研究旨在研究低硝酸盐(Low-N)和低硫 ...

编译:夕夕,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在各种非生物胁迫中,水分缺乏和重金属胁迫是限制全球作物产量的重要影响因子.目前的分子方法有助于帮助研究人员研究胁迫相关的关键调控因子, ...

编译:艾奥里亚,编辑:景行.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在磷和氮是植物生长和作物生产所必需的常量营养素.在磷饥饿条件下,植物提高了对磷酸盐(Pi)的吸收能力,但降低了对硝酸盐(NO3-) ...

拟南芥的差异分析结果注释