Seurat 4.0 || WNN整合scRNA和scATAC数据

(0)

相关推荐

  • 单细胞Marker基因可示化包Nebulosa

    与传统的转录组测序相比,单细胞测序技术噪声很大,使得单细胞转录组数据包含大量的dropout事件(导致基因表达量为0或接近0),即使是一些标记(Marker)基因也有可能表达量很低.当在使用其对聚类的 ...

  • 单细胞工具箱|Seurat官网标准流程

    学习单细胞转录组肯定先来一遍Seurat官网的标准流程. 数据来源于Peripheral Blood Mononuclear Cells (PBMC),共2700个单细胞, Illumina Next ...

  • Seurat 4.0 ||单细胞多模态数据整合算法WNN

    男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树. 生信技能树核心成员,单细胞天地特约撰稿人,简书创作者,单细胞数据科学家. 跟着Seurat团队学数学,从KNN到S ...

  • Seurat 4.0 || 分析scRNA和膜蛋白数据

    男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树. 生信技能树核心成员,单细胞天地特约撰稿人,简书创作者,单细胞数据科学家. 前情回顾 Seurat 4.0 ||您的 ...

  • sc-RAN-seq 数据分析||Seurat新版教程:整合分析

    如果只是做单个样本的sc-RNA-seq数据分析,并不能体会到Seurat的强大,因为Seurat天生为整合而生. 本教程展示的是两个pbmc数据(受刺激组和对照组)整合分析策略,执行整合分析,以便识 ...

  • Seurat 4.0 ||您的单细胞数据分析工具箱上新啦

    男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树. 生信技能树核心成员,单细胞天地特约撰稿人,简书创作者,单细胞数据科学家. 随着单细胞技术的成熟,同一细胞内的信息越 ...

  • Seurat 4.0 || 单细胞PBMC多模态参考数据集

    男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树. 生信技能树核心成员,单细胞天地特约撰稿人,简书创作者,单细胞数据科学家. 前情回顾 Seurat 4.0 ||您的 ...

  • Seurat 4.0 || 单细胞BMNC多模态参考数据集

    男, 一个长大了才会遇到的帅哥, 稳健,潇洒,大方,靠谱. 一段生信缘,一棵技能树. 生信技能树核心成员,单细胞天地特约撰稿人,简书创作者,单细胞数据科学家. 前情回顾 Seurat 4.0 || 您 ...

  • Seurat4.0系列教程14:整合scRNA-seq and scATAC-seq数据

    单细胞转录学改变了我们描述细胞状态的能力,但深入的生物学解释需要的不仅仅是分群.随着测量不同细胞模式的新方法的出现,一个关键的分析挑战是整合这些数据集,以更好地了解细胞身份和功能.例如,用户可以在同一 ...

  • 科研 | Nature子刊:整合时间序列元组学数据揭示微生物生态系统如何应对干扰

    编译:小友,编辑:Emma.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 在本篇文章中,我们研究了来自生物废水处理厂的油菜微生物种群中广泛的表型可塑性和生态位互补性,对原位样品进行元组学分析(元基因组学. ...

  • “0代码”如何拿别人的数据发自己的文章

    公共数据库挖掘呀! 众所周知,TCGA和GEO是最著名的两大公共数据库,前者主要存储高通量(二代测序)数据的肿瘤样本数据,后者GEO数据库全称Gene Expression Omnibus datab ...