文献实操 | 基于TCGA数据库免疫基因表达谱构建免疫亚组 / 开普饭

导语今天和大家分享的是2020年12月份发表在Genomics杂志上的一篇文章(IF=6.205)"miRNA biomarkers for predicting overall surv ...

最近谈到癌症的话题,可能让人立马谈"病"色变.但是早在两年前,一个生物学家利用数据分析,成功治好了自己的癌症. 为了生存奋斗 Sherley Pepke博士作为一名计算生物学家,妻 ...

Multi-dimensional omics characterization in glioblastoma identifies the purity-associated pattern an ...

大家好,今天要和大家分享的是2021年6月发表的一篇文章:"Pan-cancer methylation analysis reveals aninverse correlation of ...

Tumor immune microenvironment in cancer patients with leukocytosis白细胞增多肿瘤患者的肿瘤免疫微环境一.研究背景肿瘤相关白细胞(T ...

食管癌仅占美国癌症新诊断患者数的1%.但是,在确诊后五年内,会有80%的患者死亡,目前的治疗方法往往无法改善存活率.此外,食管腺癌的患者人数在过去四十年飙升,自七十年代中期以来增加了6倍. 在该领域内 ...

分析基本思路: 1.首先我们应该要知道什么是肿瘤的免疫细胞浸润模式,通过一些什么样的原理,可以用什么样的软件进行分析. 肿瘤免疫细胞浸润是指免疫细胞从血液中移向肿瘤组织,开始发挥它的作用,可以从肿瘤组 ...

最近看到很多人问下面这个图怎么绘制,看着确实不错.于是我查了一些资料,这个图叫split violin或者half violin,本质上是一种小提琴图.参考代码在https://gist.github ...

人工智能算法与Python大数据致力于提供深度学习.机器学习.人工智能干货文章,为AI人员提供学习路线以及前沿资讯 23篇原创内容公众号点上方人工智能算法与Python大数据获取更多干货在右上 ...

多表视图: 创建视图: CREATE VIEW grade AS SELECT c.coursename,sc.studentNo,s.`name`,sc.score FROM courses as ...

点击蓝字↑↑↑"转录组",轻松关注不迷路随着转录组学.全基因组学和蛋白组学等组学的发展,越来越多的未知功能基因和新基因相继被挖掘出来,其功能急需鉴定,而基因敲除技术是鉴定基因功能 ...

对于公共数据库分析的文章而言.目前传统的差异表达分析的思路而言,已经比较老套了.目前更多的可能是基于某一个热点来进行相关的分析.比如之前我们介绍过的一些和免疫相关的分析.另外比如今天介绍的这个和代谢相 ...

长期更新列表: 使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据(cBioPortal)TCGA的28篇教程- 使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 (离线打包版本)TCGA的28篇教程- 使用R语言的R ...

我们已经多次介绍过生存分析: 集思广益-生存分析可以随心所欲根据表达量分组吗生存分析时间点问题寻找生存分析的最佳基因表达分组阈值 apply家族函数和for循环还是有区别的(批量生存分析出图bug ...

2018年4月Immunity杂志上发表了文章The Immune Landscape of Cancer ,由34个单位共同合作完成.文章对TCGA中33种癌症,超过10,000个肿瘤样本进行了免疫 ...

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